RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 RDH13Q8NBN7 331 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 RMDN1Q96DB5 314 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 SLFN14P0C7P3 912 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 HOXA6P31267 233 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 AFMP43652 599 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 USP4Q13107 963 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF77Q15935 545 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 NME7Q9Y5B8 376 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 KLRC4O43908 158 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 TCF3P15923 654 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PDGFRLQ15198 375 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 FSIP1Q8NA03 581 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF516Q92618 1163 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PCED1BQ96HM7 432 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 SLC22A12Q96S37 553 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 MMS19Q96T76 1030 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 EBF3Q9H4W6 596 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 GCNT4Q9P109 453 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 USP17L7P0C7H9 530 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 BDNFP23560 247 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 MTF1Q14872 753 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM66O15016 1216 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 CKMP06732 381 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PDGFRBP09619 1106 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ARSAP15289 507 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PFKLP17858 780 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ATICP31939 592 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 CNR2P34972 360 aa22.24■■□□□ 1.15
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UBXN4-204ENST00000426921 TNNC1P63316 161 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 CLDN10P78369 228 aa22.24■■□□□ 1.15
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UBXN4-204ENST00000426921 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.24■■□□□ 1.15
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UBXN4-204ENST00000426921 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 LONP2Q86WA8 852 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 SNX25Q9H3E2 840 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 EXOC3O60645 756 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 TGM1P22735 817 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 GRIK1P39086 918 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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UBXN4-204ENST00000426921 CYP27A1Q02318 531 aa22.23■■□□□ 1.15
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UBXN4-204ENST00000426921 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
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UBXN4-204ENST00000426921 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PAGE5Q96GU1 130 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 C8orf48Q96LL4 319 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 DMAC2Q9NW81 257 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 EHD2Q9NZN4 543 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 C2orf78A6NCI8 922 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 MYL1P05976 194 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 FNTBP49356 437 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PDE6CP51160 858 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 AP3M2P53677 418 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 MYL6P60660 151 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 USP46P62068 366 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PSMD2Q13200 908 aa22.22■■□□□ 1.15
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