RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420233.1

PHF20-204, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene PHF20, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-204ENST00000420233 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 LRP3O75074 770 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ITGB3P05106 788 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CKMP06732 381 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 NFICP08651 508 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ZNF131P52739 623 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 EPHA5P54756 1037 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 PSMD2Q13200 908 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 LY6DQ14210 128 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 KCNB1Q14721 858 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 PON2Q15165 354 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 STK38Q15208 465 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 IL17AQ16552 155 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 C8orf34Q49A92 452 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ARSHQ5FYA8 562 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 C9orf57Q5W0N0 161 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CENPPQ6IPU0 288 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 TSSK4Q6SA08 328 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CD300LGQ6UXG3 332 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 C4orf50Q6ZRC1 276 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 SFR1Q86XK3 245 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 SYNPOQ8N3V7 929 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CPA6Q8N4T0 437 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ATAD1Q8NBU5 361 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ATP2A3Q93084 1043 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 FNBP1Q96RU3 617 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 MMS19Q96T76 1030 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CCSER1Q9C0I3 900 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 DNAI2Q9GZS0 605 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 TASP1Q9H6P5 420 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 TRPC7Q9HCX4 862 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 TDP1Q9NUW8 608 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 PANK4Q9NVE7 773 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 TBC1D7Q9P0N9 293 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ITGA11Q9UKX5 1188 aa5□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 MED13LQ71F56 2210 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ZNF233A6NK53 670 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 PIRO00625 290 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 WIPF1O43516 503 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 SOAT2O75908 522 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CYP11A1P05108 521 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 RETP07949 1114 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 USP17L7P0C7H9 530 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 TNNI1P19237 187 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 GARTP22102 1010 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 FCARP24071 287 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CTHP32929 405 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CCR2P41597 374 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 IFNAR2P48551 515 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 LHX1P48742 406 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 GUCY2FP51841 1108 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 TNNC1P63316 161 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 RBP5P82980 135 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CYP4F8P98187 520 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CFHR1Q03591 330 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ELF2Q15723 593 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ZBTB6Q15916 424 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 LPAL2Q16609 132 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 FBXO43Q4G163 708 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 HS2ST1Q7LGA3 356 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 LONP2Q86WA8 852 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 CMTM8Q8IZV2 173 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 GPD1LQ8N335 351 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 LRRC52Q8N7C0 313 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 PDILTQ8N807 584 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 MAB21L3Q8N8X9 362 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ZBTB44Q8NCP5 570 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 TTC8Q8TAM2 541 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 GIPC2Q8TF65 315 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ACDQ96AP0 544 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 SAAL1Q96ER3 474 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 EPSTI1Q96J88 318 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ZSWIM3Q96MP5 696 aa4.99□□□□□ -1.61
PHF20-204ENST00000420233 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms