RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415600.6

PTPRU-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 1,590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-203ENST00000415600 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 DMDP11532 3685 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 CLIC2O15247 247 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 PHACTR2O75167 634 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 KIF20AO95235 890 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 ADCY5O95622 1261 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 CYP2F1P24903 491 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 ANXA13P27216 316 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 PDE6CP51160 858 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 AP3M2P53677 418 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 MTAPQ13126 283 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 CUL4BQ13620 913 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 MON1AQ86VX9 555 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 SMARCE1Q969G3 411 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 PAGE5Q96GU1 130 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 PTPRJQ12913 1337 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 NOL4O94818 638 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 CLSTN1O94985 981 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 F11P03951 625 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 ATICP31939 592 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 DDR2Q16832 855 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 RUBCNQ92622 972 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 MYRFLQ96LU7 910 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 TDP1Q9NUW8 608 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 AP5Z1O43299 807 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 SMC2O95347 1197 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 PRAMEF12O95522 483 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 FZD5Q13467 585 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 FAM171BQ6P995 826 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 OSTM1Q86WC4 334 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 PKMYT1Q99640 499 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 NCANO14594 1321 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 BECN2A8MW95 431 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 TACC1O75410 805 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 CTHP32929 405 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 FAM84AQ96KN4 292 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-203ENST00000415600 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 SHISA7A6NL88 538 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 TRIM66O15016 1216 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 USP17L7P0C7H9 530 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 CHRNB1P11230 501 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 CASP1P29466 404 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 GRIK1P39086 918 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 CXCL12P48061 93 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 GPR15P49685 360 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 CYP27A1Q02318 531 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 MORC3Q14149 939 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 TXNDC8Q6A555 127 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 SPATA17Q96L03 361 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 COL4A3Q01955 1670 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 PDGFRBP09619 1106 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 DPYDQ12882 1025 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 BIRC3Q13489 604 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 PDGFRLQ15198 375 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 HS1BP3Q53T59 392 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 MYLPFQ96A32 169 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-203ENST00000415600 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms