RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 GABBR2O75899 941 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CTAGE8P0CG41 777 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 RAG1P15918 1043 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CTNNA2P26232 953 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MAN1A1P33908 653 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MFSD5Q6N075 450 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ALG3Q92685 438 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 KRT35Q92764 455 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MS4A14Q96JA4 679 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 DUSP16Q9BY84 665 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CYLDQ9NQC7 956 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PTPRDP23468 1912 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CLDN5O00501 218 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 KRT3P12035 628 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PLA2G4AP47712 749 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PEX5P50542 639 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 OGDHQ02218 1023 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 FAM171BQ6P995 826 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC43Q8N309 656 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PCED1BQ96HM7 432 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PKMYT1Q99640 499 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CARD9Q9H257 536 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MARCH5Q9NX47 278 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 EHD2Q9NZN4 543 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 NPR3P17342 541 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MARCKSL1P49006 195 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SLC11A1P49279 550 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 HSFY1Q96LI6 401 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.41■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC66A2RUB6 948 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PIK3R2O00459 728 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TRAPPC3O43617 180 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TADA2AO75478 443 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 DGKIO75912 1065 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ALDH2P05091 517 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 RASGEF1CQ8N431 466 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TOP1MTQ969P6 601 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 UPP2O95045 317 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 GALTP07902 379 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PAFAH1B1P43034 410 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SNX16P57768 344 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ITIH3Q06033 890 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC181Q5TID7 509 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 FAM35AQ86V20 835 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM199Q8N511 208 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.39■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SYN3O14994 580 aa21.39■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 BEST1O76090 585 aa21.39■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 OAZ2O95190 189 aa21.39■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.39■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 PIGZQ86VD9 579 aa21.39■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.39■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TSC1Q92574 1164 aa21.39■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 GOLGA1Q92805 767 aa21.39■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 MED10Q9BTT4 135 aa21.39■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 KRT82Q9NSB4 513 aa21.39■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 CEP104O60308 925 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms