RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 MOGSQ13724 837 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 SLC1A5Q15758 541 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 FNBP1LQ5T0N5 605 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 KIF2BQ8N4N8 673 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 ANKLE1Q8NAG6 615 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 GIMAP7Q8NHV1 300 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 CPXM1Q96SM3 734 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 GRID1Q9ULK0 1009 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 NOP56O00567 594 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 UNC5CO95185 931 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 ZWINTO95229 277 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 ACAP1Q15027 740 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 RFX6Q8HWS3 928 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 KCTD6Q8NC69 237 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 USP2O75604 605 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 PSMC4P43686 418 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 EEF1DP3Q658K8 133 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 ADGRD1Q6QNK2 874 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM50Q86XT4 487 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 ACSS3Q9H6R3 686 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 C10orf88Q9H8K7 445 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 ARIH2O95376 493 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 ERBB2P04626 1255 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 TSHRP16473 764 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 ALDH3A1P30838 453 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 MSH2P43246 934 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 GAD2Q05329 585 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 CEP120Q8N960 986 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 SPOCK2Q92563 424 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 NLRP4Q96MN2 994 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 DHRS4Q9BTZ2 278 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 MYLK2Q9H1R3 596 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 DCTN3O75935 186 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 APOC2P02655 101 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 SSTR1P30872 391 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 HSDL1Q3SXM5 330 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 MSS51Q4VC12 460 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 EMC1Q8N766 993 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 CDT1Q9H211 546 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 SIX4Q9UIU6 781 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 TNFSF13BQ9Y275 285 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 HGSO14964 777 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 B4GALT5O43286 388 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 RNF8O76064 485 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 CXCL8P10145 99 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 KRT4P19013 534 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 CDH8P55286 799 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 LVRNQ6Q4G3 990 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 SLC4A11Q8NBS3 891 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO36Q8NEA4 188 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 SDCBP2Q9H190 292 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 CD48P09326 243 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 VGLL4Q14135 290 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 UNC45BQ8IWX7 931 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 PALM2Q8IXS6 379 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 PDIK1LQ8N165 341 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 MCRS1Q96EZ8 462 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 PAFAH2Q99487 392 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 PCSK1NQ9UHG2 260 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM33Q9UPN9 1127 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 MCF2LO15068 1137 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 MIPP30301 263 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 GABRB2P47870 512 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 VSIG1Q86XK7 387 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 AGAP11Q8TF27 550 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC37BQ96QE4 947 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 EBF2Q9HAK2 575 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 ASNSD1Q9NWL6 643 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 STK38LQ9Y2H1 464 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 EVPLQ92817 2033 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD13-201ENST00000392539 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 CCND1P24385 295 aa27.64■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 C1orf127Q8N9H9 656 aa27.64■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 RSAD1Q9HA92 442 aa27.64■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 ETNK1Q9HBU6 452 aa27.64■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 CHKBQ9Y259 395 aa27.64■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 MICAL2O94851 1124 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 MBTD1Q05BQ5 628 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
HOXD13-201ENST00000392539 HSPH1Q92598 858 aa27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms