RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB22O15209 634 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 MTSS1O43312 755 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 NUMBP49757 651 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 RHBDL3P58872 404 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 MROH8Q9H579 483 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1257Q9ULG3 409 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 CYBBP04839 570 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 SH3TC2Q8TF17 1288 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 MTMR9Q96QG7 549 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 EVX2Q03828 476 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAL1Q4LDG9 190 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 NUP93Q8N1F7 819 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF606Q8WXB4 792 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 RXFP2Q8WXD0 754 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 PBXIP1Q96AQ6 731 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 DCUN1D1Q96GG9 259 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 TISP43B9A030 160 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 TMCC1O94876 653 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 DSG3P32926 999 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 RFWD2Q8NHY2 731 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM129AQ9BZQ8 928 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC10BA6NIK2 292 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 H3BRB1 525 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 SYF2O95926 243 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 TGM2P21980 687 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 IL10P22301 178 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 TMED1Q13445 227 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR49Q8IV35 697 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 EXD1Q8NHP7 514 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 BHMTQ93088 406 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 GLT1D1Q96MS3 346 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 CNPY3Q9BT09 278 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 TMBIM4Q9HC24 238 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 KBTBD13C9JR72 458 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 INSRRP14616 1297 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 MIB1Q86YT6 1006 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 SLITRK1Q96PX8 696 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 OSMRQ99650 979 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 WHRNQ9P202 907 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 USP18Q9UMW8 372 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 TBCCQ15814 346 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 SPDYAQ5MJ70 313 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 RUBCNLQ9H714 662 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 CYB561D2O14569 222 aa17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 DGKIO75912 1065 aa17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 MYO1DO94832 1006 aa17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 CNTN2Q02246 1040 aa17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 TRADDQ15628 312 aa17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 C4orf22Q6V702 233 aa17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM176AQ96HP8 235 aa17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 APOL2Q9BQE5 337 aa17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHGB4Q9UN71 923 aa17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4-202ENST00000392011 IFNA8P32881 189 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 MCOLN2Q8IZK6 566 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CALML6Q8TD86 181 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SNX5Q9Y5X3 404 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 C11orf63Q6NUN7 778 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SPIRE2Q8WWL2 714 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 VPS33BQ9H267 617 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 GRIN3BO60391 1043 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHL2O95198 593 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 HIST1H2ADP20671 130 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 AKT1P31749 480 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CYTH1Q15438 398 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CCNG2Q16589 344 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CBWD6Q4V339 395 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CBWD3Q5JTY5 395 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CBWD5Q5RIA9 395 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PLEKHH3Q7Z736 793 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CD302Q8IX05 232 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 HIST1H2AJQ99878 128 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 H2AFJQ9BTM1 129 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 FZD1Q9UP38 647 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 C2CD2LO14523 706 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 DDNO94850 711 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CASP5P51878 434 aa17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms