RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ABCB6Q9NP58 842 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 SIX2Q9NPC8 291 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 HSFX1Q9UBD0 423 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 NR2E1Q9Y466 385 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 NUMBLQ9Y6R0 609 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ATG2BQ96BY7 2078 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 F5P12259 2224 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 MYO16Q9Y6X6 1858 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 KRBA1A5PL33 1030 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 BECN2A8MW95 431 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 F8VP50 259 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 TULP2O00295 520 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ARNTLO00327 626 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 STX10O60499 249 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 GPR37L1O60883 481 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 PRAMEF12O95522 483 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 GNA14O95837 355 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 MBD3O95983 291 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CFHP08603 1231 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CSH1P0DML2 217 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CSH2P0DML3 217 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 NPR3P17342 541 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 PON1P27169 355 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 GABRR2P28476 465 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 VIPR2P41587 438 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 KLK7P49862 253 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF132P52740 706 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 EPHB3P54753 998 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 GPC5P78333 572 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CYP27A1Q02318 531 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 TYRO3Q06418 890 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 TDGQ13569 410 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CUL2Q13617 745 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 WDR44Q5JSH3 913 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CYP4A22Q5TCH4 519 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CDKAL1Q5VV42 579 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 TXNDC8Q6A555 127 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 VSTM1Q6UX27 236 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 VITQ6UXI7 678 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 HFE2Q6ZVN8 426 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 RRAGAQ7L523 313 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 FAM35AQ86V20 835 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 UNC93AQ86WB7 457 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 TTC30AQ86WT1 665 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 PLCD3Q8N3E9 789 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 SLC2A14Q8TDB8 520 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 TFAP2BQ92481 460 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CYFIP2Q96F07 1278 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM176AQ96HP8 235 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 FAXDC2Q96IV6 333 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 SPATA17Q96L03 361 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 C8orf48Q96LL4 319 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 MYRFLQ96LU7 910 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CYP2S1Q96SQ9 504 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 KXD1Q9BQD3 176 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CRACR2AQ9BSW2 395 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 GPR88Q9GZN0 384 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 RNF38Q9H0F5 515 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 THAP9Q9H5L6 903 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 TRPV4Q9HBA0 871 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ACP6Q9NPH0 428 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 ASAH2Q9NR71 780 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 CISHQ9NSE2 258 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 FAM49BQ9NUQ9 324 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 FANCLQ9NW38 375 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 OSER1Q9NX31 292 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 GDE1Q9NZC3 331 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 IL37Q9NZH6 218 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 GCNT4Q9P109 453 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 IGSF9Q9P2J2 1179 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD17-201ENST00000390930 DUSP12Q9UNI6 340 aa3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms