RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 TLR10Q9BXR5 811 aa25.91■■□□□ 1.74
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ECHDC3-201ENST00000379215 SIGLEC16A6NMB1 481 aa25.9■■□□□ 1.74
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ECHDC3-201ENST00000379215 HERVK_113Q902F9 699 aa25.86■■□□□ 1.73
ECHDC3-201ENST00000379215 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
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ECHDC3-201ENST00000379215 DESP17661 470 aa25.85■■□□□ 1.73
ECHDC3-201ENST00000379215 USP41Q3LFD5 358 aa25.85■■□□□ 1.73
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa25.85■■□□□ 1.73
ECHDC3-201ENST00000379215 CEP112Q8N8E3 955 aa25.85■■□□□ 1.73
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM169Q96HH4 297 aa25.85■■□□□ 1.73
ECHDC3-201ENST00000379215 PBKQ96KB5 322 aa25.85■■□□□ 1.73
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC4Q9HBW1 653 aa25.85■■□□□ 1.73
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