RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.617e-8■■■□□ 17.2
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FAAP20-201ENST00000378543 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 GTSE1Q9NYZ3 720 aa25.11■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 FAM186AA6NE01 2351 aa25.11■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 CYP27A1Q02318 531 aa25.1■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 MON1AQ86VX9 555 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-201ENST00000378543 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-201ENST00000378543 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 VPS13AQ96RL7 3174 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-201ENST00000378543 DMDP11532 3685 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-201ENST00000378543 IKBKBO14920 756 aa25.09■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 TNK2Q07912 1038 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-201ENST00000378543 PNOCQ13519 176 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-201ENST00000378543 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-201ENST00000378543 VSTM1Q6UX27 236 aa25.09■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 MSANTD3Q96H12 275 aa25.09■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 DPEP3Q9H4B8 488 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-201ENST00000378543 SOBPA7XYQ1 873 aa25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-201ENST00000378543 KINO60870 393 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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FAAP20-201ENST00000378543 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa25.07■■□□□ 1.6
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FAAP20-201ENST00000378543 ZNF528Q3MIS6 628 aa25.07■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 CEP135Q66GS9 1140 aa25.07■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 TSSK4Q6SA08 328 aa25.07■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 SEMA4AQ9H3S1 761 aa25.07■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 SMYD3Q9H7B4 428 aa25.07■■□□□ 1.6
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FAAP20-201ENST00000378543 RAP1GAPP47736 663 aa25.06■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF699Q32M78 642 aa25.06■■□□□ 1.6
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FAAP20-201ENST00000378543 SLC22A12Q96S37 553 aa25.06■■□□□ 1.6
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FAAP20-201ENST00000378543 FAM83CQ9BQN1 747 aa25.06■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 KIF9Q9HAQ2 790 aa25.06■■□□□ 1.6
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FAAP20-201ENST00000378543 CLSTN1O94985 981 aa25.05■■□□□ 1.6
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FAAP20-201ENST00000378543 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 CACNA2D1P54289 1103 aa25.05■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 USP46P62068 366 aa25.05■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 ADAM9Q13443 819 aa25.05■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 ZACNQ401N2 412 aa25.05■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.05■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF667Q5HYK9 610 aa25.05■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.05■■□□□ 1.6
FAAP20-201ENST00000378543 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.05■■□□□ 1.6
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