RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 CCL14Q16627 93 aa10.49□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 KLHL38Q2WGJ6 581 aa10.49□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 TAF2Q6P1X5 1199 aa10.49□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.49□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 PKNOX2Q96KN3 472 aa10.49□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa10.49□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 SKIP12755 728 aa10.49□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 PLA2G4AP47712 749 aa10.49□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 FNTAP49354 379 aa10.49□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.49□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 MAMLD1Q13495 774 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 NXNQ6DKJ4 435 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 LRIG3Q6UXM1 1119 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM121Q9BTD3 319 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 CAPN7Q9Y6W3 813 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 COL1A2P08123 1366 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 MARCKSL1P49006 195 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 FAXCQ5TGI0 409 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ATP11CQ8NB49 1132 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 SLC2A14Q8TDB8 520 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 SIX2Q9NPC8 291 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 CST3P01034 146 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 FLT3LGP49771 235 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 LIG3P49916 1009 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 SP3Q02447 781 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 MCL1Q07820 350 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ADIGQ0VDE8 80 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 GAD1Q99259 594 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 MYH15Q9Y2K3 1946 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 E5RJQ4 531 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 TREHO43280 583 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 PAEPP09466 180 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 KYNUQ16719 465 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 NBPF20Q3BBV1 942 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF662Q6ZS27 426 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 TTC17Q96AE7 1141 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 TRIM62Q9BVG3 475 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 MAF1Q9H063 256 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 PDZD7Q9H5P4 517 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 CHMP2BQ9UQN3 213 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 F8VP50 259 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ATP9BO43861 1147 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 FAM153BP0C7A2 387 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 NUMBP49757 651 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 FAM153CQ494X1 144 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ELMOD1Q8N336 334 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ARRDC4Q8NCT1 418 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 EXD1Q8NHP7 514 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 DMAC2Q9NW81 257 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 FAM153AQ9UHL3 310 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.48□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 RBP3P10745 1247 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 TKTL1P51854 596 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 HELQQ8TDG4 1101 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 BTNL10A8MVZ5 291 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 SUN1O94901 812 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 BRAFP15056 766 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 LHX1P48742 406 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 SCNN1GP51170 649 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 SLC29A2Q14542 456 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 IFT43Q96FT9 208 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 DDIT4Q9NX09 232 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 TRIM17Q9Y577 477 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC78A2IDD5 438 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 RASSF10A6NK89 507 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 GOLGA8RI6L899 631 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 RARAP10276 462 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 MAGEA4P43358 317 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 NUGGCQ68CJ6 796 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 FAM131BQ86XD5 332 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 PALB2Q86YC2 1186 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ADAM2Q99965 735 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 SYT15Q9BQS2 421 aa10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms