RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PTGISQ16647 500 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYE7PQ495Y7 208 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SV2AQ7L0J3 742 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ARMC2Q8NEN0 867 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM169Q96HH4 297 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PXMP2Q9NR77 195 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP10O43572 662 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SRP72O76094 671 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 THPOP40225 353 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 BCAT1P54687 386 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 FCGRTP55899 365 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CHI3L2Q15782 390 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 IL17RAQ96F46 866 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CNPY3Q9BT09 278 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 STAG3L1P0CL83 205 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 RHOBTB1O94844 696 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 FBXW4P57775 412 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CYP24A1Q07973 514 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC3Q13217 504 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 FAXCQ5TGI0 409 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 WDR49Q8IV35 697 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 RASSF10A6NK89 507 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CYTH1Q15438 398 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 MRNIPQ6NTE8 343 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 METTL7BQ6UX53 244 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PROSCO94903 275 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 AMHR2Q16671 573 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 WHRNQ9P202 907 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TGFB3P10600 412 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 C2CD6Q53TS8 623 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 VPS37AQ8NEZ2 397 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 LOC100653049A0A140TA62 436 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SOAT2O75908 522 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 KRT34O76011 436 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SERPIND1P05546 499 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PGK2P07205 417 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CXCL9Q07325 125 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL9Q3SXZ7 439 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 EXD1Q8NHP7 514 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CISHQ9NSE2 258 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 E2F8A0AVK6 867 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CRLS1Q9UJA2 301 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TRIP10Q15642 601 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 DNERQ8NFT8 737 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PNKPQ96T60 521 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 H0Y626 953 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ADCY3O60266 1144 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM16O95361 564 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ATICP31939 592 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 NSL1Q96IY1 281 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 BLOC1S6Q9UL45 172 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CCND1P24385 295 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 DAB2P98082 770 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CDH18Q13634 790 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC4FQ8N1N0 589 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF555Q8NEP9 628 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TRPC5OSA6NMA1 111 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CYB561D2O14569 222 aa21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms