RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349062.6

TRIM4-201, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 3,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-201ENST00000349062 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SLC26A2P50443 739 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 CDH6P55285 790 aa14.61□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 RIPK2O43353 540 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 FAM107AO95990 144 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PTPRFP10586 1907 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 MED7O43513 233 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 B4GALT4O60513 344 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 NUMBP49757 651 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.074e-6■□□□□ 8.6
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TRIM4-201ENST00000349062 H7C0C1 242 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 ATP5OP48047 213 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 AP3M2P53677 418 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 FSBPO95073 299 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 IL18RAPO95256 599 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 CDC25CP30307 473 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ELF1P32519 619 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 GDF10P55107 478 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 HIC1Q14526 733 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRIM4-201ENST00000349062 GNASQ5JWF2 1037 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 RPAINQ86UA6 219 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 HESX1Q9UBX0 185 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 I3L4J1 428 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CLDN5O00501 218 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 PSTPIP1O43586 416 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 STRNO43815 780 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 MCF2P10911 925 aa14.58□□□□□ -0.08
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