RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 L1RE1Q9UN81 338 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 FGFR1P11362 822 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 VDRP11473 427 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CD19P15391 556 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.4□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 LTBP2Q14767 1821 aa6.39□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 PRELID1Q9Y255 219 aa6.39□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 MICAL2O94851 1124 aa6.39□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 SENP8Q96LD8 212 aa6.39□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.38□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 HCRTO43612 131 aa6.38□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 DDHD2O94830 711 aa6.38□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TIMP1P01033 207 aa6.38□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 LMO2P25791 158 aa6.38□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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