RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 GIPC3Q8TF64 312 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 IRGQQ8WZA9 623 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ABHD8Q96I13 439 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 AK5Q9Y6K8 562 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 CLUHO75153 1309 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 CYB561D2O14569 222 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 COPEO14579 308 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 SLITRK3O94933 977 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 POLR2MP0CAP2 368 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ALDH1A3P47895 512 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 CD151P48509 253 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 OXCT1P55809 520 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 IRX4P78413 519 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 FAAP100Q0VG06 881 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 PEX6Q13608 980 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 MORF4L2Q15014 288 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 NUP93Q8N1F7 819 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 E2F7Q96AV8 911 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 CSRNP1Q96S65 589 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 Q9H521 79 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 DMAC2Q9NW81 257 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 SLIT2O94813 1529 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 TMEM247A6NEH6 219 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 FAM86B1E9PN63 330 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 LIASO43766 372 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 INHBAP08476 426 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 PDGFRBP09619 1106 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 HOXD12P35452 270 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 BTDP43251 543 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ETV4P43268 484 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 HDAC4P56524 1084 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 RPS8P62241 208 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 SLF2Q8IX21 1173 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 LRRC43Q8N309 656 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 APOL6Q9BWW8 343 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 PPCSQ9HAB8 311 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 RRN3Q9NYV6 651 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 LAMB1P07942 1786 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 K7ENM7 598 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 MSH4O15457 936 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 DNAJA2O60884 412 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ZMPSTE24O75844 475 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 FAM155BO75949 473 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 TNFAIP8O95379 198 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 CPOXP36551 454 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 DYNLT1P63172 113 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 PHEXP78562 749 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 XIAPP98170 497 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF543Q08ER8 600 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 PICALMQ13492 652 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 PDK1Q15118 436 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 USH1GQ495M9 461 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms