RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 USP18Q9UMW8 372 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 FBXO21O94952 628 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 MAP3K6O95382 1288 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 MAP3K7CLP57077 242 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 CBWD6Q4V339 395 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 SNX19Q92543 992 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ETFBP38117 255 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 NDST1P52848 882 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 FAXCQ5TGI0 409 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TRPA1O75762 1119 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 FBXO32Q969P5 355 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 EPN3Q9H201 632 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 PEAK1Q9H792 1746 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TLR2O60603 784 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 NDUFS3O75489 264 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 HSD17B3P37058 310 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 HADHAP40939 763 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 MIB1Q86YT6 1006 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 LACTBL1A8MY62 500 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ITGB5P18084 799 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TWF1Q12792 350 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 WDR93Q6P2C0 686 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TRIM15Q9C019 465 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 MYPNQ86TC9 1320 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 FDFT1P37268 417 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 FAM131BQ86XD5 332 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 CALML6Q8TD86 181 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TINF2Q9BSI4 451 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 AXLP30530 894 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 DGKZQ13574 1117 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 COPS5Q92905 334 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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LRP5-201ENST00000294304 LTN1O94822 1766 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 SETSIPP0DME0 302 aa22.11■■□□□ 1.13
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LRP5-201ENST00000294304 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 PLA2G6O60733 806 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 BMP6P22004 513 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 DDIASQ8IXT1 998 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 NFASCO94856 1347 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 SLC11A2P49281 568 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TAF11Q15544 211 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TMEM120BA0PK00 339 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 MYO1CO00159 1063 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.135e-8■■■■■ 31.1
LRP5-201ENST00000294304 ZNF263O14978 683 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 LRG1P02750 347 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 HOXC6P09630 235 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ANXA9O76027 345 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 GHRP10912 638 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 KLRG1Q96E93 195 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 POMCP01189 267 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 GTF2BQ00403 316 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 STX3Q13277 289 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 SYT15Q9BQS2 421 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 H0Y3Z8 333 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 ESRRBO95718 433 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 MOB2Q70IA6 237 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP5-201ENST00000294304 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.1■■□□□ 1.13
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