RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293230.9

CYGB-201, Transcript of cytoglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYGB, Length 2,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYGB-201ENST00000293230 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 GINS2Q9Y248 185 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 SCN1AP35498 2009 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 CD48P09326 243 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ARSEP51690 589 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 DYNLT1P63172 113 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 LMNB2Q03252 620 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 INCA1Q0VD86 236 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ACVR2BQ13705 512 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 BBOF1Q8ND07 529 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 C9orf72Q96LT7 481 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 PTPN18Q99952 460 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 TINF2Q9BSI4 451 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.36■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 PIK3R2O00459 728 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 GABRB2P47870 512 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 TAF5Q15542 800 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 CENPTQ96BT3 561 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 KIF12Q96FN5 646 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 P4HA1P13674 534 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 CNGA2Q16280 664 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 KYAT1Q16773 422 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.35■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 PPEF2O14830 753 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 NPTXRO95502 500 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 HMGCRP04035 888 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 VDRP11473 427 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 CREB1P16220 341 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ELF1P32519 619 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 GRM5P41594 1212 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 RBP5P82980 135 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 GPS1Q13098 491 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 DGKDQ16760 1214 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ZNF410Q86VK4 478 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 C12orf29Q8N999 325 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 KAT2BQ92831 832 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 SERPINB12Q96P63 405 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 KRT7P08729 469 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 RAB6CQ53S08 254 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 TRNP1Q6NT89 227 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 RELL1Q8IUW5 271 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.34■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ITGAVP06756 1048 aa20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 KDELR1P24390 212 aa20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 MIPP30301 263 aa20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 CDR1P51861 262 aa20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 ACTL9Q8TC94 416 aa20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 SNTG2Q9NY99 539 aa20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 HES2Q9Y543 173 aa20.33■□□□□ 0.85
CYGB-201ENST00000293230 C5orf60A6NFR6 353 aa20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 CST8O60676 142 aa20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 PFKMP08237 780 aa20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 DRD4P21917 467 aa20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 GDF10P55107 478 aa20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 PLCB3Q01970 1234 aa20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 TAZQ16635 292 aa20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.32■□□□□ 0.84
CYGB-201ENST00000293230 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms