RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 TGM2P21980 687 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SOX6P35712 828 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NUP107P57740 925 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 BNIPLQ7Z465 357 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 USP33Q8TEY7 942 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ARMCX1Q9P291 453 aa6.58□□□□□ -1.36
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SBNO1-201ENST00000267176 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 DLC1Q96QB1 1528 aa6.58□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 HLA-DRAP01903 254 aa6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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SBNO1-201ENST00000267176 PTPN7P35236 360 aa6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ADRM1Q16186 407 aa6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.57□□□□□ -1.36
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SBNO1-201ENST00000267176 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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SBNO1-201ENST00000267176 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 GCNAQ96QF7 691 aa6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CD274Q9NZQ7 290 aa6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KNL1Q8NG31 2342 aa6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.57□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TBC1D12O60347 775 aa6.57□□□□□ -1.36
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