RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 BIRC5O15392 142 aa7.55□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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CSDE1-201ENST00000261443 CYP3A7P24462 503 aa7.55□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CPOXP36551 454 aa7.55□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PSMD7P51665 324 aa7.55□□□□□ -1.2
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CSDE1-201ENST00000261443 GSTM4Q03013 218 aa7.55□□□□□ -1.2
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CSDE1-201ENST00000261443 BRD8Q9H0E9 1235 aa7.55□□□□□ -1.2
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CSDE1-201ENST00000261443 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.55□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 STK24Q9Y6E0 443 aa7.55□□□□□ -1.2
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CSDE1-201ENST00000261443 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7.54□□□□□ -1.2
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CSDE1-201ENST00000261443 ATG16L1Q676U5 607 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PAOXQ6QHF9 649 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 Q6ZNX1 250 aa7.54□□□□□ -1.2
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CSDE1-201ENST00000261443 AHI1Q8N157 1196 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ALLCQ8N6M5 410 aa7.54□□□□□ -1.2
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CSDE1-201ENST00000261443 FAM81BQ96LP2 452 aa7.54□□□□□ -1.2
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CSDE1-201ENST00000261443 PI4K2BG5E9Z4 385 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 SGK1O00141 431 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 KCNQ2O43526 872 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PSTPIP1O43586 416 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PROSCO94903 275 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 SLITRK3O94933 977 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CCR3P51677 355 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 NR1H2P55055 460 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 HDAC4P56524 1084 aa7.54□□□□□ -1.2
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