RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 TREML1Q86YW5 311 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 HELQQ8TDG4 1101 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 NGLY1Q96IV0 654 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 TCF12Q99081 682 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 STOML1Q9UBI4 398 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 C6orf229H3BNL8 230 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 FBP2O00757 339 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 THAP12O43422 761 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PLS3P13797 630 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 CYP11B1P15538 503 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 FOXN2P32314 431 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 MXI1P50539 228 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PTPROQ16827 1216 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 EXD1Q8NHP7 514 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 EGLN2Q96KS0 407 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 CENPOQ9BU64 300 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 DYTNA2CJ06 578 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 YDJCA8MPS7 323 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 TEX28O15482 410 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ATP9AO75110 1047 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ZWINTO95229 277 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 LYNP07948 512 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 GCAP28676 217 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 SEPT6Q14141 434 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ODR4Q5SWX8 454 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 LRRC38Q5VT99 294 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 GIPC2Q8TF65 315 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 DPF3Q92784 378 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PNMA3Q9UL41 463 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 CHKBQ9Y259 395 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 KMOO15229 486 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 TYROBPO43914 113 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 B4GALT4O60513 344 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PROSCO94903 275 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 TGDSO95455 350 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 SGPL1O95470 568 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PTPN4P29074 926 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 CYP2J2P51589 502 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 RTP1P59025 263 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 CLDN10P78369 228 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ZBTB17Q13105 803 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 RCN2Q14257 317 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 GRM2Q14416 872 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 MUM1Q2TAK8 710 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 KAZNQ674X7 775 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 C14orf80Q86SX3 495 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 POLIQ9UNA4 740 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 BPTFQ12830 3046 aa6.59□□□□□ -1.36
SGIP1-201ENST00000237247 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SGIP1-201ENST00000237247 NDUFB10O96000 172 aa6.59□□□□□ -1.36
SGIP1-201ENST00000237247 TGFB3P10600 412 aa6.59□□□□□ -1.36
SGIP1-201ENST00000237247 COL6A2P12110 1019 aa6.59□□□□□ -1.36
SGIP1-201ENST00000237247 BMP3P12645 472 aa6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms