RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225474.6

CSF3-201, Transcript of colony stimulating factor 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSF3, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3-201ENST00000225474 MYO1EQ12965 1108 aa14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 PLD1Q13393 1074 aa14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 TRIM14Q14142 442 aa14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 TEAD2Q15562 447 aa14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 GDE1Q9NZC3 331 aa14.97□□□□□ -0.01
CSF3-201ENST00000225474 PSMD6Q15008 389 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 TAF12Q16514 161 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 CCDC142Q17RM4 750 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 OSTM1Q86WC4 334 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 WDR49Q8IV35 697 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 STKLD1Q8NE28 680 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 MMS19Q96T76 1030 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.96□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 CLSTN1O94985 981 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ATF6P18850 670 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 VIPR2P41587 438 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 GPR15P49685 360 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 MYL7Q01449 175 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 GRM2Q14416 872 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ZNF516Q92618 1163 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 CGRRF1Q99675 332 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 LRRC3Q9BY71 257 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.95□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 NRDCO43847 1150 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ATP2C2O75185 946 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 PDGFRBP09619 1106 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 GABRR2P28476 465 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 EPHA5P54756 1037 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 KCNH2Q12809 1159 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 VEPH1Q14D04 833 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 SYCP1Q15431 976 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 TMC8Q8IU68 726 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 LEMD2Q8NC56 503 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 PSMG2Q969U7 264 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 IQCDQ96DY2 449 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ACBD6Q9BR61 282 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.94□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 PHACTR2O75167 634 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ECI2O75521 394 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 CD72P21854 359 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 LMO2P25791 158 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 LHX1P48742 406 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 TRPC3Q13507 836 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 DDR2Q16832 855 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 GAREM2Q75VX8 874 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ITIH5Q86UX2 942 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 SLC35C1Q96A29 364 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ASB16Q96NS5 453 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 NUP58Q9BVL2 599 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 ASB3Q9Y575 518 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 COL4A3Q01955 1670 aa14.93□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.92□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 MICAL2O94851 1124 aa14.92□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 FCARP24071 287 aa14.92□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 CYP2F1P24903 491 aa14.92□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 VAMP7P51809 220 aa14.92□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 MYL6P60660 151 aa14.92□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 CYP4F8P98187 520 aa14.92□□□□□ -0.02
CSF3-201ENST00000225474 SMARCB1Q12824 385 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms