RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRC3Q9BY71 257 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT82Q9NSB4 513 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 F8VP50 259 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 KLK7P49862 253 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF132P52740 706 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 ZP2Q05996 745 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 VEPH1Q14D04 833 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 TMC8Q8IU68 726 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM81BQ96LP2 452 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 MED10Q9BTT4 135 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP8B3O60423 1300 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 SP100P23497 879 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 GRIK1P39086 918 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 CCR2P41597 374 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 MFAP3P55082 362 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 UBXN1Q04323 297 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 ITIH5Q86UX2 942 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 SHC3Q92529 594 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 C8orf48Q96LL4 319 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNK16Q96T55 309 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 ASAH2Q9NR71 780 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-201ENST00000225308 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM66O15016 1216 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 PAEPP09466 180 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ADORA2BP29275 332 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 MTMR3Q13615 1198 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 SYCP1Q15431 976 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ITFG1Q8TB96 612 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA17Q96L03 361 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 USTQ9Y2C2 406 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 FHOD1Q9Y613 1164 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 AP1G2O75843 785 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 BEST1O76090 585 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 UCHL3P15374 230 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 FSHRP23945 695 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ZMIZ2Q8NF64 920 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TCEAL4Q96EI5 215 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 SMOQ99835 787 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TEX33O43247 280 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 NOL4O94818 638 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CSH1P0DML2 217 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CSH2P0DML3 217 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TPM4P67936 248 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 GAREM2Q75VX8 874 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 LEMD2Q8NC56 503 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 GANQ9H2C0 597 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1B0GTH6 734 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 EPHB6O15197 1021 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 MOSPD3O75425 235 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CALCAP01258 141 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM200BP0CF97 657 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT5P13647 590 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CD19P15391 556 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 RFX1P22670 979 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ANXA13P27216 316 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 SGO2Q562F6 1265 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TFAP2BQ92481 460 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms