RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rad9bQ6WBX7 403 aa17.7■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc38a9Q8BGD6 560 aa17.7■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Depdc1bQ8BH88 529 aa17.7■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ints6lQ8BND4 861 aa17.7■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Uchl3Q9JKB1 230 aa17.7■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Grb14Q9JLM9 538 aa17.7■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 EmcnQ9R0H2 261 aa17.7■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lrrc73B2RWC4 316 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 9330159F19RikD3Z623 648 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Oas1aP11928 367 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kif2aP28740 705 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cetn1P41209 172 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Uchl4P58321 233 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 BC051142Q3V0M8 400 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 H2-Q2Q4KN81 360 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 MmeQ61391 750 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Wdr44Q6NVE8 915 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hook3Q8BUK6 718 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Oas1gQ8K469 367 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ctage5Q8R311 779 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pcdhb2Q91Y00 799 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pin4Q9CWW6 131 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pdzd4Q9QY39 772 aa17.69■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam71aB7XG49 585 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Scrg1O88745 98 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 PkmP52480 531 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dpf3P58269 378 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 IhhP97812 411 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Wnt8aQ64527 354 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 VillQ91YD6 859 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam49bQ921M7 324 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lgals2Q9CQW5 130 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Timp4Q9JHB3 224 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cdh23Q99PF4 3354 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trappc3O55013 180 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Enpp1P06802 906 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rps6ka1P18653 724 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gdf7P43029 461 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rad54lP70270 747 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dennd1bQ3U1T9 766 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rmdn3Q3UJU9 470 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Olfml2bQ3V1G4 746 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krt35Q497I4 455 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Thnsl1Q8BH55 747 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rhpn2Q8BWR8 686 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Efcab8Q8C9R9 203 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Leng8Q8CBY3 785 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 IntS13Q8QZV7 732 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Olfr348Q8VGK3 313 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 NamptQ99KQ4 491 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rnf34Q99KR6 376 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cfap57Q9D180 1249 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Padi3Q9Z184 664 aa17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Foxn2E9Q7L6 429 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm5160F8VPN3 147 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Xirp1O70373 1129 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Myl1P05977 188 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cd44P15379 778 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Smyd1P97443 490 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Aarsd1Q3THG9 412 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dmc1Q61880 340 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pde1cQ64338 706 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Olfr670Q7TRP3 312 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sytl5Q80T23 753 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mical2Q8BML1 960 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bpifb6Q8BU51 449 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Q8C1R3 189 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Adam33Q923W9 797 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ctnnbl1Q9CWL8 563 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Llcfc1Q9D9P8 108 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Iigp1Q9QZ85 413 aa17.67■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rp1P56716 2095 aa17.66■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Samd1D3YXK1 519 aa17.66■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zfp266E9Q2S7 604 aa17.66■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Serpinb6bO08804 377 aa17.66■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Edil3O35474 480 aa17.66■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dsg3O35902 993 aa17.66■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01631 113 aa17.66■□□□□ 0.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Adcyap1r1P70205 496 aa17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.2 ms