RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PapolaQ61183 739 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PolnQ7TQ07 864 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ahcyl1Q80SW1 530 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdtc1Q80ZK9 677 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taf5Q8C092 801 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CntrobQ8CB62 887 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sugp2Q8CH09 1067 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abhd8Q8R0P8 439 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tasp1Q8R1G1 420 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hkdc1Q91W97 915 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Emc2Q9CRD2 297 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp623Q9CY99 499 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Actrt1Q9D9J3 376 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gadd45gQ9Z111 159 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11549A0A286YD83 63 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssxb9A2BI93 185 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mroh5E9PUJ8 762 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp94E9Q6Y4 486 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspyl1O88852 379 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Magea6O89010 325 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Icam1P13597 537 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcna3P16390 528 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gja8P28236 440 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 YwhagP61982 247 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zscan2Q07230 614 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cage1Q5IR70 849 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpatch2lQ6PE65 482 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SrlQ7TQ48 910 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapk15Q80Y86 549 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r43Q80Z08 845 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nlrp4aQ8BU40 982 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nipal4Q8BZF2 406 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adgra1Q8C4G9 578 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdik1lQ8QZR7 341 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr449Q8VGW8 311 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Epn3Q91W69 636 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpt1bQ924X2 772 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Polr3cQ9D483 533 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rmi1Q9D4G9 616 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbp7Q9EPC5 134 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmod4Q9JLH8 345 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Actl7bQ9QY83 418 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aldh18a1Q9Z110 795 aa6.9□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup10A2BIN1 180 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup14A2CEK7 180 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup19A9C497 187 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup15A9R9W0 180 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup17B5X0G2 180 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm1141B9EJU1 475 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup8E9PVW0 235 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp651E9PZ11 729 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup7E9QA79 235 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pagr1bF6V0H0 108 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Farp1F8VPU2 1048 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm379J3QQ19 296 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3424L7N298 263 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8246M0QWX9 263 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup6P02762 180 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup1P11588 180 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup2P11589 180 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ZfxP17012 799 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NppbP40753 121 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PkmP52480 531 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 S100a5P63084 93 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 InhbaQ04998 424 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 9130409I23RikQ3TS87 320 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kctd8Q50H33 476 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hmgb4Q6P8W9 181 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 March4Q80TE3 409 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf365Q8BG89 408 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BoraQ8BS90 525 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc7a14Q8BXR1 771 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DaglbQ91WC9 669 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adi1Q99JT9 179 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nt5c3aQ9D020 331 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrps9Q9D7N3 390 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tk2Q9R088 270 aa6.9□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm29554A0A087WNW4 188 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl41A2AUC9 606 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r103E9PWW0 856 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtproE9Q612 1226 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AunipE9Q6Z5 340 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Raph1F2Z3U3 1266 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.3 ms