RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdha9Q91Y11 979 aa13.27□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3404Q9D506 307 aa13.27□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajb7Q9QYI8 312 aa13.27□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf25Q9QZR0 456 aa13.27□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mzf1S4R1L6 814 aa13.27□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ThadaA8C756 1938 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt28A6BLY7 462 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr161B2RPY5 545 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rfx8D3YU81 596 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtgisO35074 501 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fcer2P20693 331 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gjb3P28231 270 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PkmP52480 531 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pih1d3Q3KNI6 218 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrgprb8Q7TN51 330 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata20Q80YT5 790 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx17Q8BVL3 470 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bag2Q91YN9 210 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nsmce1Q9D720 266 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Doc2gQ9ESN1 387 aa13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttll8A4Q9F1 832 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pex10B1AUE5 324 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GckP52792 465 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RalaP63321 206 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sox8Q04886 464 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tp53i13Q5F267 385 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klra3Q64329 266 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf12Q7TSI0 686 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Man2a2Q8BRK9 1152 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phka2Q8BWJ3 1235 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfap36Q8C6E0 343 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab44Q8CB87 725 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htra2Q9JIY5 458 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmed2Q9R0Q3 201 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ZxdbA2CE44 873 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcb5B5X0E4 1255 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp35M0QWN7 1009 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ass1P16460 412 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ces1cP23953 554 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UrosP51163 265 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc1a1P51906 523 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phactr1Q2M3X8 580 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Orc2Q60862 576 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Birc2Q62210 612 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plk4Q64702 925 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr18Q6PAN7 307 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mical2Q8BML1 960 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ClasrpQ8CFC7 668 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtmr14Q8VEL2 648 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TarsQ9D0R2 722 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep83Q9D5R3 692 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ecel1Q9JMI0 775 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdzd4Q9QY39 772 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MycP01108 439 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl7aP12970 266 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CalrP14211 416 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ect2Q07139 913 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrch2Q3UMG5 773 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Skap1Q3UUV5 355 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam81aQ3UXZ6 364 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tab3Q571K4 716 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acvrl1Q61288 502 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wscd1Q80XH4 572 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iqsec1Q8R0S2 961 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RragcQ99K70 398 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc71Q9D3W5 558 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AuhQ9JLZ3 314 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Egfl7Q9QXT5 275 aa13.26□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam47eD3YWC7 402 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc27a2O35488 620 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atf2P16951 487 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RarbP22605 482 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col6a1Q04857 1025 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh3bp2Q06649 559 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankmy2Q3TPE9 440 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frmd5Q6P5H6 517 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr670Q7TRP3 312 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pnma2Q8BHK0 365 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ldlrap1Q8C142 308 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tph2Q8CGV2 488 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r203Q8R273 311 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmed5Q9CXE7 229 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nphs1Q9QZS7 1256 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hao1Q9WU19 370 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dock3Q8CIQ7 2027 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc63A6H694 637 aa13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.5 ms