RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mical2Q8BML1 960 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CcinQ8CDE2 588 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Znf445Q8R2V3 986 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rab7bQ8VEA8 199 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tcaf2Q921K8 919 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nccrp1G3X9C2 266 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ess2O70279 479 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Samsn1P57725 372 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cldn11Q60771 207 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MogQ61885 246 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PostnQ62009 838 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp397Q7TNK4 527 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mtmr3Q8K296 1196 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Atoh8Q99NA2 322 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Msantd3Q9CR78 275 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mdm1Q9D067 708 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pus3Q9JI38 481 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sdr16c6Q05A13 316 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lpar5Q149R9 372 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ndst1Q3UHN9 882 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Eif2b4Q61749 524 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ctdp1Q7TSG2 960 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Epb41l5Q8BGS1 731 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ephb1Q8CBF3 984 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Snrnp35Q9D384 244 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 P2yr13Q9D8I2 337 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc25a19Q9DAM5 318 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GsdmeQ9Z2D3 512 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Scn11aQ9R053 1765 aa7.55□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Diaph2O70566 1098 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Il13ra2O88786 383 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fgd3O88842 733 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Xkr5Q5GH66 676 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zswim9Q6DI92 447 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ints8Q80V86 995 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Skida1Q80YR3 822 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kctd6Q8BNL5 237 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PreplQ8C167 725 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wdr60Q8C761 999 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc15a4Q91W98 574 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cts3Q91ZD5 332 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tubb4aQ9D6F9 444 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TnmdQ9EP64 317 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnf14Q9JI90 485 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Clec1bQ9JL99 229 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rfx1P48377 963 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Togaram2Q3TYG6 1002 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fastkd1Q6DI86 829 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kyat3Q71RI9 455 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Art3Q8R2G4 371 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rsrc1Q9DBU6 334 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tor1bQ9ER41 336 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Per1O35973 1291 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Il2rbP16297 539 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 UoxP25688 303 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Guca1aP43081 202 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ephb4P54761 987 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ptgs2Q05769 604 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MlxipQ2VPU4 917 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Itih3Q61704 889 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Inppl1Q6P549 1257 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Phf8Q80TJ7 1023 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpr153Q8K0Z9 631 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sec13Q9D1M0 322 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Phospho2Q9D9M5 241 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gadd45gQ9Z111 159 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Umodl1Q5DID3 1319 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 BC034090A0A087WP46 1202 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lzts3A2AHG0 700 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Clk2O35491 499 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tcea3P23881 347 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpr143P70259 405 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tbx1P70323 479 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm28047Q3US59 414 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Clec4a4Q5YIR8 236 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PrcpQ7TMR0 491 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rps6ka6Q7TPS0 764 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr23Q7TRX4 325 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Me3Q8BMF3 604 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmem74Q8BQU7 305 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kcnj14Q8JZN3 434 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm42417Q8K1D0 126 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tram1l1Q8QZR0 363 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AslQ91YI0 464 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pcyox1Q9CQF9 505 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ddit4Q9D3F7 229 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rassf7Q9DD19 359 aa7.54□□□□□ -1.2
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.2 ms