RNA–Protein interactions for RNA: YMR255W

GFD1, Transcript of Coiled-coiled protein of unknown function, yeast

Gene GFD1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GFD1	YMR255W	FYV7	Q12247	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	MRS1	P07266	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	GPI18	P38211	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	TOM7	P53507	60 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	HST4	P53688	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	SDH7	Q04401	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	NDE2	Q07500	545 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	ATO3	Q12359	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	FZF1	P32805	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YKL187C	P34231	750 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YER134C	P40081	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	RPA43	P46669	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	GIM5	Q04493	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	MHR1	Q06630	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	POM33	Q12164	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	ATP5	P09457	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	PAU16	P35994	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YFL067W	P43537	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YJL028W	P47062	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	COX2	P00410	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	SPS100	P13130	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	RRT1	P38192	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	GLE2	P40066	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	IMP2	P46972	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	TDA4	P47153	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	SBH2	P52871	88 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	IRC25	Q07951	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	BPH1	P25356	2167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	ZRT1	P32804	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	AME1	P38313	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	TEM1	P38987	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	MST28	P39552	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	SDS23	P53172	527 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	SAE3	P89114	91 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	NAT5	Q08689	176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	TIM18	Q08749	192 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	CSM4	Q08955	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	FCY1	Q12178	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	JID1	Q12350	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	HTB2	P02294	131 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	CYC3	P06182	269 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	TIR2	P33890	251 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	GAT2	P40209	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	YFR045W	P43617	309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	YGL118C	P53132	145 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	BRP1	P53194	125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	DAD4	P69851	72 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	YPS1	P32329	569 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	YMR141C	P40211	102 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	NCA3	P46955	337 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	SCW10	Q04951	389 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	CNL1	Q06333	122 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	IRC23	Q08416	157 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	TRA1	P38811	3744 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	MIG1	P27705	504 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	PAU7	P39545	55 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	CSI2	Q08054	341 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	DAD1	Q12248	94 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	TEL1	P38110	2787 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	CPT1	P17898	393 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	YIR020C	P40575	100 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	GLC8	P41818	229 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	BET5	Q03630	159 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	MEC1	P38111	2368 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
GFD1	YMR255W	SEC11	P15367	167 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 85.1 ms