RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	YDR366C	P87287	132 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPC24	YMR117C	FIT3	Q08907	204 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPC24	YMR117C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	SFT2	P38166	215 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	SPG1	P50088	95 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	YPL067C	Q02754	198 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	YOR385W	Q08909	290 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	YMR321C	Q04898	105 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	MRPL44	P19956	98 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	EMC4	P53073	190 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	YMR320W	Q04897	101 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	PFY1	P07274	126 aa		0.84	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	YBR013C	P38215	129 aa		0.84	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	YGL149W	P53116	101 aa		0.84	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	BRP1	P53194	125 aa		0.84	□□□□□ -2.27
SPC24	YMR117C	LAA1	P39526	2014 aa		0.84	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	GSC2	P40989	1895 aa		0.83	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	MIC27	P50945	234 aa		0.82	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	HHO1	P53551	258 aa		0.82	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	YGR039W	P53225	103 aa		0.8	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	SPC3	Q12133	184 aa		0.8	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	YLR296W	Q05898	108 aa		0.79	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	QCR10	P37299	77 aa		0.78	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	MED11	Q99278	115 aa		0.78	□□□□□ -2.28
SPC24	YMR117C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
SPC24	YMR117C	HAP3	P13434	144 aa		0.77	□□□□□ -2.29
SPC24	YMR117C	GTT2	Q12390	233 aa		0.77	□□□□□ -2.29
SPC24	YMR117C	ATP14	Q12349	124 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SPC24	YMR117C	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SPC24	YMR117C	SNT2	P53127	1403 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SPC24	YMR117C	SDH7	Q04401	133 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SPC24	YMR117C	LDB18	Q07887	179 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SPC24	YMR117C	YAP3	P38749	330 aa		0.73	□□□□□ -2.29
SPC24	YMR117C	HPM1	P40481	377 aa		0.72	□□□□□ -2.29
SPC24	YMR117C	RTC6	O14464	93 aa		0.71	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	PAU21	P0CE86	164 aa		0.71	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	PAU22	P0CE87	164 aa		0.71	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	YCR050C	P25630	102 aa		0.71	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	HSP10	P38910	106 aa		0.71	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	AIM18	P38884	321 aa		0.7	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	YAL064W	P39711	94 aa		0.7	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	ELC1	Q03071	99 aa		0.7	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	YLR194C	Q05777	254 aa		0.68	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.67	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		0.67	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	0.67	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	POR2	P40478	281 aa		0.66	□□□□□ -2.3
SPC24	YMR117C	QCR6	P00127	147 aa		0.64	□□□□□ -2.31
SPC24	YMR117C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SPC24	YMR117C	SRX1	P36077	127 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SPC24	YMR117C	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SPC24	YMR117C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
SPC24	YMR117C	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
SPC24	YMR117C	YIL163C	P40448	117 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SPC24	YMR117C	YJR128W	P47162	119 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SPC24	YMR117C	YGR017W	P53210	297 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SPC24	YMR117C	TVP18	Q04767	167 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SPC24	YMR117C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	CSN9	Q03981	162 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	BLM10	P43583	2143 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	PHS1	P40857	217 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	SNF2	P22082	1703 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	HPA2	Q06592	156 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	ENV10	Q99382	181 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	TRS20	P38334	175 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	ICS3	P47034	131 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	ARL3	Q02804	198 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	TRM732	Q03496	1420 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SPC24	YMR117C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
SPC24	YMR117C	ERV14	P53173	138 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPC24	YMR117C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPC24	YMR117C	YFR035C	P43608	114 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPC24	YMR117C	HYM1	P32464	399 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPC24	YMR117C	OCA6	Q12454	224 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPC24	YMR117C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPC24	YMR117C	BNI1	P41832	1953 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPC24	YMR117C	SEC59	P20048	519 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPC24	YMR117C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SPC24	YMR117C	AUA1	P32450	94 aa		0.47	□□□□□ -2.33

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