RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	ATP20	Q12233	115 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	ATO3	Q12359	275 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	MSW1	P04803	379 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	CTR2	P38865	189 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	SPC25	P40014	221 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	BUD25	P85052	153 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	ELC1	Q03071	99 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	TVP18	Q04767	167 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	SCW10	Q04951	389 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	KTI11	Q3E840	82 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS1B	YML063W	GPA2	P10823	449 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	not detected
RPS1B	YML063W	RPB11	P38902	120 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	GON7	P46984	123 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	EST3	Q03096	181 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	RRT7	Q07829	113 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YOR268C	Q08734	132 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	TRS20	P38334	175 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YEL073C	P39974	107 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YFL012W	P43580	148 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	PAC10	P48363	199 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	SPG1	P50088	95 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YNR062C	P53748	327 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	RNH202	Q05635	350 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	ANT1	Q06497	328 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	VPS68	Q12016	184 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	MEC1	P38111	2368 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	ETR1	P38071	380 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	RRT1	P38192	103 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YER135C	P40082	130 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	SBH1	P52870	82 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	DOC1	P53068	250 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YPR063C	Q12160	140 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	SCM4	P32564	187 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	MID2	P36027	376 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YKR032W	P36127	104 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YNR064C	P53750	290 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	LIP1	Q03579	150 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YLR042C	Q07990	161 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	TRA1	P38811	3744 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	PHS1	P40857	217 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	ATP19	P81451	68 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	FYV12	Q08559	129 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	HUT1	Q12520	339 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	MDH2	P22133	377 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YCR099C	P25657	155 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YEL045C	P32616	141 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	MPC3	P53311	146 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	HAL1	Q01766	294 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	ATG40	Q99325	256 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS1B	YML063W	VAR1	P02381	398 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	MRPS9	P38120	278 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	YHR180W	P38868	163 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	YNL217W	P40152	326 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	RTR2	Q12378	196 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	MRS4	P23500	304 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	FZF1	P32805	299 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	YOR062C	P36025	268 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	PAM17	P36147	197 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	SML1	Q04964	104 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	YOR015W	Q12169	119 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	YCR050C	P25630	102 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	SFT2	P38166	215 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	MPM1	P40364	252 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	FLX1	P40464	311 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	YIR035C	P40579	254 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	YOL162W	P0CF19	215 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	YBR209W	P38311	105 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPS1B	YML063W	YGL230C	P53074	147 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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