RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	POF1	P25576	258 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	HIT1	P46973	164 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	NAT3	Q06504	195 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	COQ3	P27680	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	FZF1	P32805	299 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	SIT1	P39980	628 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	BRP1	P53194	125 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	DAD3	P69850	94 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	CRC1	Q12289	327 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	TIM21	P53220	239 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	AIM34	Q03673	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	MRPL28	P36527	147 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YNL217W	P40152	326 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	ATP14	Q12349	124 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	SEC59	P20048	519 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	ELF1	P36053	145 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	IRC22	P40006	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	PGD1	P40356	397 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	TIR1	P10863	254 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	SPC1	P46965	94 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YGR017W	P53210	297 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	KRE9	P39005	276 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YGR026W	P53217	278 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	ATP23	P53722	227 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	ORM2	Q06144	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	CSM4	Q08955	156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	DCN1	Q12395	269 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	SRB6	P32570	121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YPT53	P36019	220 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	PHS1	P40857	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	LDS1	P31379	325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	SRP21	P32342	167 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	SUR2	P38992	349 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	GAT4	P40569	121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	MOG1	P47123	218 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	RPB11	P38902	120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	SRP14	P38985	146 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	GIM5	Q04493	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	YPR195C	Q06594	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	MGA1	P53050	456 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	DXO1	Q06349	442 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	DGA1	Q08650	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
PUF3	YLL013C	QRI5	P32344	111 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	YHR140W	P38842	239 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	BNS1	P50084	137 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	PBA1	Q05778	276 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	YCR023C	P25351	611 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	LAC1	P28496	418 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	TEM1	P38987	245 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	ATG33	Q06485	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	ANB1	P19211	157 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	YJL028W	P47062	111 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	CUP2	P15315	225 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	YGL010W	P25338	174 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	GPI19	Q04082	140 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	MRPS9	P38120	278 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	TVP18	Q04767	167 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	GTO3	Q04806	366 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	DPP1	Q05521	289 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	ZRT1	P32804	376 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	HSP10	P38910	106 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	PAU7	P39545	55 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	PAU5	P43575	122 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	PMP3	P87284	55 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	APS2	Q00381	147 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	RTC6	O14464	93 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	MIX23	P38162	196 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	SVP26	P38869	228 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PUF3	YLL013C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PUF3	YLL013C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PUF3	YLL013C	YIL024C	P40543	189 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PUF3	YLL013C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PUF3	YLL013C	PAM17	P36147	197 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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