RNA–Protein interactions for RNA: YGR279C

SCW4, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW4, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW4	YGR279C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	DAD3	P69850	94 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	QRI5	P32344	111 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	ELF1	P36053	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
SCW4	YGR279C	SUR2	P38992	349 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	IRC22	P40006	225 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	YDL183C	P48569	320 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	DAD1	Q12248	94 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	GTT1	P40582	234 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	YCH1	P42937	148 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	YDR274C	P87283	123 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	GIM5	Q04493	163 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCW4	YGR279C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	PAU3	P25610	124 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	MIG1	P27705	504 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	PAU5	P43575	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	DAN1	P47178	298 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	SNO1	Q03144	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	RAV2	Q03956	351 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	SRP14	P38985	146 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	AGE2	P40529	298 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	VMA21	P41806	77 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YFR045W	P43617	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	CAX4	P53223	239 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	DAD4	P69851	72 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YDR366C	P87287	132 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YPR013C	Q12145	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	POM33	Q12164	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	VAR1	P02381	398 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	POP7	P38291	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YHR022C	P38763	256 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	PAU7	P39545	55 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	KEG1	P43614	200 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	NAT3	Q06504	195 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	STP4	Q07351	490 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	DYN1	P36022	4092 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	LCB3	P47013	409 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	MIC26	P50087	233 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YGR026W	P53217	278 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	TOM7	P53507	60 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	VPS71	Q03433	280 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	TIM22	Q12328	207 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YLR302C	O13544	120 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	MIX23	P38162	196 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YIL163C	P40448	117 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	COX12	Q01519	83 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	CSM4	Q08955	156 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	ATP16	Q12165	160 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	MDM10	P18409	493 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	MST28	P39552	234 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	GET2	P40056	285 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YER135C	P40082	130 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	SIM1	P40472	476 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	MST27	P53176	234 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	BRP1	P53194	125 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	DIA1	P54005	336 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	PRM7	Q12459	698 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCW4	YGR279C	YGL010W	P25338	174 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	YHR140W	P38842	239 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	RPB11	P38902	120 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	MIG3	P39943	394 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	YFR035C	P43608	114 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	HIT1	P46973	164 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	VAM10	Q08474	114 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	VHS2	P40463	436 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	GPI19	Q04082	140 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SCW4	YGR279C	AGA1	P32323	725 aa		4	□□□□□ -1.77

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