RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C YBR242WP38331 238 aa4.7□□□□□ -1.66
SHO1YER118C YAL064WP39711 94 aa4.7□□□□□ -1.66
SHO1YER118C FLX1P40464 311 aa4.7□□□□□ -1.66
SHO1YER118C GNA1P43577 159 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SHO1YER118C LSM8P47093 109 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SHO1YER118C YNR077CP53758 84 aa4.7□□□□□ -1.66
SHO1YER118C GRX5Q02784 150 aa4.7□□□□□ -1.66
SHO1YER118C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SHO1YER118C YIR035CP40579 254 aa4.69□□□□□ -1.66
SHO1YER118C PAM16P42949 149 aa4.69□□□□□ -1.66
SHO1YER118C NSE4P43124 402 aa4.69□□□□□ -1.66
SHO1YER118C PIR5P46999 287 aa4.69□□□□□ -1.66
SHO1YER118C BAT2P47176 376 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SHO1YER118C UPS1Q05776 175 aa4.69□□□□□ -1.66
SHO1YER118C UIP4Q08926 304 aa4.69□□□□□ -1.66
SHO1YER118C ATG40Q99325 256 aa4.69□□□□□ -1.66
SHO1YER118C AIM18P38884 321 aa4.68□□□□□ -1.66
SHO1YER118C YOR376W-AQ3E805 51 aa4.68□□□□□ -1.66
SHO1YER118C YKL068W-AQ3E826 78 aa4.68□□□□□ -1.66
SHO1YER118C VMR1P38735 1592 aa4.68□□□□□ -1.66
SHO1YER118C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
SHO1YER118C KRE5P22023 1365 aa4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C RPS23BP0CX30 145 aa4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C UBC5P15732 148 aa4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C SCM4P32564 187 aa4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C YHL042WP38729 150 aa4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C YEA6P39953 335 aa4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C RPL33BP41056 107 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C THG1P53215 237 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C RCE1Q03530 315 aa4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SHO1YER118C HYP2P23301 157 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SHO1YER118C MIG1P27705 504 aa4.66□□□□□ -1.66
SHO1YER118C YEL045CP32616 141 aa4.66□□□□□ -1.66
SHO1YER118C TMA19P35691 167 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SHO1YER118C MPC1P53157 130 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SHO1YER118C ATP19P81451 68 aa4.66□□□□□ -1.66
SHO1YER118C HAP1P0CE41 1502 aa4.66□□□□□ -1.66
SHO1YER118C IML1P47170 1584 aa4.65□□□□□ -1.66
SHO1YER118C DNF2Q12675 1612 aa4.65□□□□□ -1.66
SHO1YER118C SRL3P36167 246 aa4.65□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YOR015WQ12169 119 aa4.65□□□□□ -1.67
SHO1YER118C INO4P13902 151 aa4.64□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YOR385WQ08909 290 aa4.64□□□□□ -1.67
SHO1YER118C FEX1Q08913 375 aa4.64□□□□□ -1.67
SHO1YER118C FEX2Q08991 375 aa4.64□□□□□ -1.67
SHO1YER118C FKS1P38631 1876 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YCR099CP25657 155 aa4.63□□□□□ -1.67
SHO1YER118C CLB6P32943 380 aa4.63□□□□□ -1.67
SHO1YER118C BOL2P53082 120 aa4.63□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YGR164WP53291 111 aa4.63□□□□□ -1.67
SHO1YER118C PIR1Q03178 341 aa4.63□□□□□ -1.67
SHO1YER118C MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YLR236CA0A023PZG4 107 aa4.62□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SHO1YER118C UPS3Q04006 179 aa4.62□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YMR103CQ04436 120 aa4.62□□□□□ -1.67
SHO1YER118C TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SHO1YER118C HAP3P13434 144 aa4.61□□□□□ -1.67
SHO1YER118C MRPS9P38120 278 aa4.61□□□□□ -1.67
SHO1YER118C TIR3P40552 269 aa4.61□□□□□ -1.67
SHO1YER118C KEI1Q06346 221 aa4.61□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YDL241WQ07738 123 aa4.61□□□□□ -1.67
SHO1YER118C ATG41Q12048 136 aa4.61□□□□□ -1.67
SHO1YER118C NUP192P47054 1683 aa4.61□□□□□ -1.67
SHO1YER118C UTH1P36135 365 aa4.6□□□□□ -1.67
SHO1YER118C CCS1P40202 249 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SHO1YER118C ERG25P53045 309 aa4.6□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YHP1Q04116 353 aa4.6□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YDR114CQ04597 100 aa4.6□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YPR013CQ12145 317 aa4.6□□□□□ -1.67
SHO1YER118C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SHO1YER118C MED11Q99278 115 aa4.6□□□□□ -1.67
SHO1YER118C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YML079WQ03629 201 aa4.59□□□□□ -1.67
SHO1YER118C SOM1Q05676 74 aa4.59□□□□□ -1.67
SHO1YER118C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SHO1YER118C IRC19Q07843 230 aa4.59□□□□□ -1.67
SHO1YER118C RPL26AP05743 127 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SHO1YER118C QCR10P37299 77 aa4.58□□□□□ -1.68
SHO1YER118C ERV15P38312 142 aa4.58□□□□□ -1.68
SHO1YER118C YEL067CP39978 195 aa4.58□□□□□ -1.68
SHO1YER118C YFR035CP43608 114 aa4.58□□□□□ -1.68
SHO1YER118C CIS3P47001 227 aa4.58□□□□□ -1.68
SHO1YER118C RPL26BP53221 127 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SHO1YER118C CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SHO1YER118C YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SHO1YER118C GTT2Q12390 233 aa4.58□□□□□ -1.68
SHO1YER118C YBR209WP38311 105 aa4.57□□□□□ -1.68
SHO1YER118C YER084WP40057 128 aa4.57□□□□□ -1.68
SHO1YER118C YIL059CP40520 121 aa4.57□□□□□ -1.68
SHO1YER118C NHP10Q03435 203 aa4.57□□□□□ -1.68
SHO1YER118C RAF1Q06891 181 aa4.57□□□□□ -1.68
SHO1YER118C YCR075W-AQ3E830 75 aa4.57□□□□□ -1.68
SHO1YER118C BCK1Q01389 1478 aa4.56□□□□□ -1.68
SHO1YER118C YGL041W-AP0C5N3 154 aa4.56□□□□□ -1.68
SHO1YER118C YCL001W-AP87012 153 aa4.56□□□□□ -1.68
SHO1YER118C COX5BP00425 151 aa4.55□□□□□ -1.68
SHO1YER118C MAK31P23059 88 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15 ms