RNA–Protein interactions for RNA: YER086W

ILV1, Transcript of Threonine deaminase, catalyzes first step in isoleucine biosynthesis, yeast

Gene ILV1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ILV1	YER086W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	PAU3	P25610	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	AGE2	P40529	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	PAU5	P43575	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	NAT3	Q06504	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	DCN1	Q12395	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	TIR1	P10863	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	PHD1	P36093	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	CAB4	P53332	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	TIR2	P33890	251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	ELF1	P36053	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	TOS8	P53147	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	TOM7	P53507	60 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	FYV6	P53913	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	QRI5	P32344	111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	YCR041W	P37265	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	AME1	P38313	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	YPI1	P43587	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	HTB2	P02294	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YPT10	P38146	199 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YBR090C	P38253	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	SNF11	P38956	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	LAS17	Q12446	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YGL010W	P25338	174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YIP3	P53633	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	UBC7	Q02159	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	ATG39	Q06159	398 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	FIP1	P45976	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	PRY2	P36110	329 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	MIX23	P38162	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	HUA1	P40325	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	PRM3	Q08931	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	IRC22	P40006	225 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	SPI1	P40092	148 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	LCB3	P47013	409 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	FZF1	P32805	299 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YMR141C	P40211	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YFR045W	P43617	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	DUG3	P53871	357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	COX16	P47081	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	DAD4	P69851	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	MSA1	Q08471	629 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	DAD1	Q12248	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	CUP2	P15315	225 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	RPA43	P46669	326 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ILV1	YER086W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	UTR5	P32630	166 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	PAM17	P36147	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	CPT1	P17898	393 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YGR025W	P53216	100 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	CAX4	P53223	239 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	CYT2	Q00873	224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	ARL3	Q02804	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	DXO1	Q06349	442 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	CSM4	Q08955	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	MRPL28	P36527	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	TDA4	P47153	279 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	UPS3	Q04006	179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	MED7	Q08278	222 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	CCW12	Q12127	133 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	RPB11	P38902	120 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	YFR057W	P43625	151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ILV1	YER086W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57 ms