RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W YOR1P53049 1477 aa0.6□□□□□ -2.31
NTF2YER009W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
NTF2YER009W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
NTF2YER009W ANB1P19211 157 aa0.59□□□□□ -2.31
NTF2YER009W LSM8P47093 109 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
NTF2YER009W YDR366CP87287 132 aa0.59□□□□□ -2.31
NTF2YER009W FUN14P18411 198 aa0.58□□□□□ -2.32
NTF2YER009W SFT2P38166 215 aa0.58□□□□□ -2.32
NTF2YER009W YPL067CQ02754 198 aa0.58□□□□□ -2.32
NTF2YER009W YLR157W-EP0CF00 54 aa0.57□□□□□ -2.32
NTF2YER009W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
NTF2YER009W SPG1P50088 95 aa0.57□□□□□ -2.32
NTF2YER009W FIT3Q08907 204 aa0.57□□□□□ -2.32
NTF2YER009W HUG1Q6Q5K6 68 aa0.57□□□□□ -2.32
NTF2YER009W BRP1P53194 125 aa0.56□□□□□ -2.32
NTF2YER009W YOR034C-AQ3E735 80 aa0.56□□□□□ -2.32
NTF2YER009W MRPL44P19956 98 aa0.55□□□□□ -2.32
NTF2YER009W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
NTF2YER009W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
NTF2YER009W YGL149WP53116 101 aa0.55□□□□□ -2.32
NTF2YER009W COF1Q03048 143 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
NTF2YER009W EMC4P53073 190 aa0.54□□□□□ -2.32
NTF2YER009W EFM5P53200 248 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
NTF2YER009W YGR039WP53225 103 aa0.54□□□□□ -2.32
NTF2YER009W HHO1P53551 258 aa0.54□□□□□ -2.32
NTF2YER009W URA2P07259 2214 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
NTF2YER009W PFY1P07274 126 aa0.53□□□□□ -2.32
NTF2YER009W QCR10P37299 77 aa0.53□□□□□ -2.32
NTF2YER009W YBR013CP38215 129 aa0.53□□□□□ -2.32
NTF2YER009W RBL2P48606 106 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
NTF2YER009W MIC27P50945 234 aa0.53□□□□□ -2.32
NTF2YER009W YMR321CQ04898 105 aa0.53□□□□□ -2.32
NTF2YER009W SPC3Q12133 184 aa0.53□□□□□ -2.32
NTF2YER009W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
NTF2YER009W TY4B-JP47024 1803 aa0.51□□□□□ -2.33
NTF2YER009W YLR296WQ05898 108 aa0.51□□□□□ -2.33
NTF2YER009W GTT2Q12390 233 aa0.51□□□□□ -2.33
NTF2YER009W QCR6P00127 147 aa0.5□□□□□ -2.33
NTF2YER009W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
NTF2YER009W YCR050CP25630 102 aa0.5□□□□□ -2.33
NTF2YER009W RPC19P28000 142 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
NTF2YER009W YAP3P38749 330 aa0.5□□□□□ -2.33
NTF2YER009W RTC6O14464 93 aa0.49□□□□□ -2.33
NTF2YER009W HAP3P13434 144 aa0.49□□□□□ -2.33
NTF2YER009W HPM1P40481 377 aa0.49□□□□□ -2.33
NTF2YER009W AIM18P38884 321 aa0.48□□□□□ -2.33
NTF2YER009W YAL064WP39711 94 aa0.48□□□□□ -2.33
NTF2YER009W SDH7Q04401 133 aa0.48□□□□□ -2.33
NTF2YER009W SNT2P53127 1403 aa0.47□□□□□ -2.33
NTF2YER009W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
NTF2YER009W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
NTF2YER009W HSP10P38910 106 aa0.47□□□□□ -2.33
NTF2YER009W LDB18Q07887 179 aa0.47□□□□□ -2.33
NTF2YER009W ATP14Q12349 124 aa0.47□□□□□ -2.33
NTF2YER009W PAU21P0CE86 164 aa0.46□□□□□ -2.34
NTF2YER009W PAU22P0CE87 164 aa0.46□□□□□ -2.34
NTF2YER009W YLR194CQ05777 254 aa0.46□□□□□ -2.34
NTF2YER009W MED11Q99278 115 aa0.46□□□□□ -2.34
NTF2YER009W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
NTF2YER009W GSP1P32835 219 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
NTF2YER009W PRS3P38689 320 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
NTF2YER009W ELC1Q03071 99 aa0.45□□□□□ -2.34
NTF2YER009W YRF1-3P0CX14 1859 aa0.44□□□□□ -2.34
NTF2YER009W YRF1-7P0CX15 1859 aa0.44□□□□□ -2.34
NTF2YER009W BLM10P43583 2143 aa0.44□□□□□ -2.34
NTF2YER009W POR2P40478 281 aa0.43□□□□□ -2.34
NTF2YER009W TVP18Q04767 167 aa0.43□□□□□ -2.34
NTF2YER009W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
NTF2YER009W TRS20P38334 175 aa0.42□□□□□ -2.34
NTF2YER009W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
NTF2YER009W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
NTF2YER009W PHS1P40857 217 aa0.41□□□□□ -2.34
NTF2YER009W BNI1P41832 1953 aa0.41□□□□□ -2.34
NTF2YER009W TY1B-HO13535 1793 aa0.4□□□□□ -2.35
NTF2YER009W SRX1P36077 127 aa0.4□□□□□ -2.35
NTF2YER009W YIL163CP40448 117 aa0.4□□□□□ -2.35
NTF2YER009W YGR017WP53210 297 aa0.4□□□□□ -2.35
NTF2YER009W CSN9Q03981 162 aa0.4□□□□□ -2.35
NTF2YER009W YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa0.4□□□□□ -2.35
NTF2YER009W EMP24P32803 203 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
NTF2YER009W YJR128WP47162 119 aa0.39□□□□□ -2.35
NTF2YER009W SNF2P22082 1703 aa0.38□□□□□ -2.35
NTF2YER009W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
NTF2YER009W MPC1P53157 130 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
NTF2YER009W HYM1P32464 399 aa0.36□□□□□ -2.35
NTF2YER009W GIM4P40005 111 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
NTF2YER009W ERV14P53173 138 aa0.36□□□□□ -2.35
NTF2YER009W HPA2Q06592 156 aa0.36□□□□□ -2.35
NTF2YER009W CYC2P38909 366 aa0.35□□□□□ -2.35
NTF2YER009W ENV10Q99382 181 aa0.35□□□□□ -2.35
NTF2YER009W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
NTF2YER009W SEC59P20048 519 aa0.34□□□□□ -2.36
NTF2YER009W AUA1P32450 94 aa0.34□□□□□ -2.36
NTF2YER009W RPS20P38701 121 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
NTF2YER009W YFR035CP43608 114 aa0.34□□□□□ -2.36
NTF2YER009W ICS3P47034 131 aa0.34□□□□□ -2.36
NTF2YER009W TRM732Q03496 1420 aa0.34□□□□□ -2.36
NTF2YER009W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
NTF2YER009W LCL1Q02786 101 aa0.33□□□□□ -2.36
NTF2YER009W YDR278CQ05612 105 aa0.33□□□□□ -2.36
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