RNA–Protein interactions for RNA: YBR246W

RRT2, Transcript of Methylesterase performing penultimate step of diphthamide biosynthesis, yeast

Gene RRT2, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT2	YBR246W	YJL028W	P47062	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	MIC27	P50945	234 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	WSC2	P53832	503 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	LIP2	Q06005	328 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	QRI5	P32344	111 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	ZRT1	P32804	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	PAM17	P36147	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YBR090C	P38253	122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	ECO1	P43605	281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	CRZ1	P53968	678 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	HSK3	P69852	69 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	RRG8	Q06109	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	PRM3	Q08931	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	MRPS5	P33759	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	MRPL39	P36533	70 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	MIC12	P38341	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	TEM1	P38987	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	SAS2	P40963	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YFL065C	P43539	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	FPR2	P32472	135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YAR068W	P39564	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YNL198C	P40166	100 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	UBC13	P52490	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YIP1	P53039	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	ATP19	P81451	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	LPP1	Q04396	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	RAF1	Q06891	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	MRS3	P10566	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	COX10	P21592	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	INO2	P26798	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	MTC6	P38849	526 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YHR173C	P38864	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YER084W	P40057	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YDL186W	P48568	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YGL230C	P53074	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YNR064C	P53750	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YHP1	Q04116	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	SEC11	P15367	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	CMC1	P36064	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	UTH1	P36135	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	ATX1	P38636	73 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YGL118C	P53132	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YML079W	Q03629	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	CPT1	P17898	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YNL194C	P40169	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YIL059C	P40520	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YFR057W	P43625	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	GON7	P46984	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	TDA4	P47153	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	NRM1	P53718	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	AIM11	P87275	137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	NUP53	Q03790	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	RAV2	Q03956	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	FIT2	Q08906	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT2	YBR246W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	BRP1	P53194	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	GEP3	Q08622	556 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	RFM1	Q12192	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	UBC5	P15732	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	YFR045W	P43617	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	YJL118W	P47022	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	SBH1	P52870	82 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	ALG13	P53178	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	CAB4	P53332	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	MRX11	Q03079	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	BLM10	P43583	2143 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT2	YBR246W	PHO85	P17157	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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