RNA–Protein interactions for RNA: YAL058W

CNE1, Transcript of Calnexin, yeast

Gene CNE1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CNE1	YAL058W	YCR007C	P25354	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	MRX11	Q03079	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	AYT1	Q12226	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	ATO3	Q12359	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	MRS1	P07266	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YPT10	P38146	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YHL044W	P38727	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	ECM14	P38836	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YER121W	P40076	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YFR045W	P43617	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	MIC26	P50087	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	HST4	P53688	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YNR064C	P53750	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	SED1	Q01589	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	HTB2	P02294	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	DAL80	P26343	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YKR045C	P36138	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YMR141C	P40211	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YJL213W	P40896	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YPI1	P43587	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	DPP1	Q05521	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	IZH3	Q07959	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	TIM18	Q08749	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YPS1	P32329	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	CTR2	P38865	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	SOR2	Q07786	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	CYC3	P06182	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	MDM10	P18409	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	PAU7	P39545	55 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	DAD4	P69851	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	RUB1	Q03919	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	RXT3	Q07458	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	PET8	P38921	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YIL012W	P40551	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	SBH2	P52871	88 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	VPS71	Q03433	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	SDH7	Q04401	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	SAL1	D6W196	494 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	CPT1	P17898	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YGR017W	P53210	297 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YNL234W	P53857	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	EOS1	P53938	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YNL046W	P53956	172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	BET5	Q03630	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	GTO3	Q04806	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	IRC25	Q07951	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	MRP49	P32388	137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	TIR2	P33890	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	GLE2	P40066	365 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	MIX17	Q03667	156 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	DAD1	Q12248	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	PRY2	P36110	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YKR032W	P36127	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	RRT1	P38192	103 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	MBB1	P39534	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	IMP2	P46972	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	CAB4	P53332	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	AIM29	P36154	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YNL198C	P40166	100 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	AGE2	P40529	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	NCA3	P46955	337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	IRC23	Q08416	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YIR020C	P40575	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YJL163C	P46996	555 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	NCE103	P53615	221 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YCR023C	P25351	611 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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