RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ZNF536O15090 1300 aa21.5■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 CYP24A1Q07973 514 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 TBX20Q9UMR3 447 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 ATP2A1O14983 1001 aa21.49■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 RAPH1Q70E73 1250 aa21.49■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 CPT1BQ92523 772 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 NCSTNQ92542 709 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 ZNF516Q92618 1163 aa21.49■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 CAPN14A8MX76 684 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 PLCB3Q01970 1234 aa21.49■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 COA1Q9GZY4 146 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.49■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.49■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.48■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.48■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 CDK7P50613 346 aa21.48■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 ULK2Q8IYT8 1036 aa21.48■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 BBS9Q3SYG4 887 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 FAM91A1Q658Y4 838 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 SH2D5Q6ZV89 423 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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