RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631023.2

CLN3-240, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-240ENST00000631023 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 VSTM1Q6UX27 236 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 GIPC2Q8TF65 315 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 NXPE3Q969Y0 559 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 MED15Q96RN5 788 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 GDE1Q9NZC3 331 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 LRRN2O75325 713 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 NDST1P52848 882 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 KCNH2Q12809 1159 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 PTPN21Q16825 1174 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CCDC142Q17RM4 750 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ING5Q8WYH8 240 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 THAP9Q9H5L6 903 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ATP8B3O60423 1300 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 TRIOO75962 3097 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CSH1P0DML2 217 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CSH2P0DML3 217 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 BDNFP23560 247 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 INCA1Q0VD86 236 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 DDR2Q16832 855 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 KCNK12Q9HB15 430 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ANO10Q9NW15 660 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ASGR2P07307 311 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 PTMSP20962 102 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ANXA13P27216 316 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 GRIK1P39086 918 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ACOT1Q86TX2 421 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 TATDN2Q93075 761 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 LRRC3Q9BY71 257 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 GPR88Q9GZN0 384 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 TRIM66O15016 1216 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CEBPBP17676 345 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CD58P19256 250 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CCR2P41597 374 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 MTMR3Q13615 1198 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 MTSS1LQ765P7 747 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 TMC8Q8IU68 726 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 GPR152Q8TDT2 470 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 GCNAQ96QF7 691 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 OBSL1O75147 1896 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CDC25CP30307 473 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 GPR15P49685 360 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 TDGQ13569 410 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 SPATA17Q96L03 361 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 NT5C1BQ96P26 610 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 MED10Q9BTT4 135 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 A0A1W2PRU2 124 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ANHXE9PGG2 379 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CILPO75339 1184 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 GABRR2P28476 465 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 STX1AQ16623 288 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 EDAQ92838 391 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 CISHQ9NSE2 258 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CLN3-240ENST00000631023 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.02■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 ZXDAP98168 799 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 CUL2Q13617 745 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 GAREM2Q75VX8 874 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 C8orf48Q96LL4 319 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 EHD2Q9NZN4 543 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 TECTAO75443 2155 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 CLDN5O00501 218 aa22■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 MOSPD3O75425 235 aa22■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CLN3-240ENST00000631023 GJA1P17302 382 aa22■■□□□ 1.11
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