RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
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CTDP1-208ENST00000613122 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
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CTDP1-208ENST00000613122 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.98■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 SGPL1O95470 568 aa20.97■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 INSRRP14616 1297 aa20.97■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 HLA-DPA1P20036 260 aa20.97■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 RAP1GAPP47736 663 aa20.97■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 ITGA8P53708 1063 aa20.97■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 OCA2Q04671 838 aa20.97■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 GRIN1Q05586 938 aa20.97■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 GIT2Q14161 759 aa20.97■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 HIC1Q14526 733 aa20.97■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.97■□□□□ 0.95
CTDP1-208ENST00000613122 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.97■□□□□ 0.95
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