RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TFAP2BQ92481 460 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SHC3Q92529 594 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SPAG5Q96R06 1193 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC9A7Q96T83 725 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 BCO2Q9BYV7 579 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CISHQ9NSE2 258 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 EPOPA6NHQ4 379 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CLDN5O00501 218 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 HUS1O60921 280 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ALDH2P05091 517 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MMEP08473 750 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CD19P15391 556 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CHRNB2P17787 502 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ADORA2BP29275 332 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ATICP31939 592 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CA8P35219 290 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CTNNB1P35222 781 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RAD23BP54727 409 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MFAP3P55082 362 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBED6P86452 979 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CCZ1BP86790 482 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO1EQ12965 1108 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RTP2Q5QGT7 225 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 HGSNATQ68CP4 663 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 FUT10Q6P4F1 479 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PALB2Q86YC2 1186 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM139Q8IV31 216 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 FIBCD1Q8N539 461 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf29Q8N999 325 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 STKLD1Q8NE28 680 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ACDQ96AP0 544 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SUSD3Q96L08 255 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF560Q96MR9 790 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF558Q96NG5 402 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 DESI2Q9BSY9 194 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NUP58Q9BVL2 599 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 STK33Q9BYT3 514 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PQJ5 194 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 THAP12O43422 761 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 EFCAB14O75071 495 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CILPO75339 1184 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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