RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF4-216ENST00000586813 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAF4-216ENST00000586813 SEMA4GQ9NTN9 838 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAF4-216ENST00000586813 PANK4Q9NVE7 773 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAF4-216ENST00000586813 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TRAF4-216ENST00000586813 SIX4Q9UIU6 781 aa20.79■□□□□ 0.92
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TRAF4-216ENST00000586813 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.77■□□□□ 0.92
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TRAF4-216ENST00000586813 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
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TRAF4-216ENST00000586813 ATP2C2O75185 946 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAF4-216ENST00000586813 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TRAF4-216ENST00000586813 TNNC2P02585 160 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAF4-216ENST00000586813 DRD1P21728 446 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAF4-216ENST00000586813 MAGEA11P43364 429 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAF4-216ENST00000586813 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TRAF4-216ENST00000586813 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
TRAF4-216ENST00000586813 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAF4-216ENST00000586813 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAF4-216ENST00000586813 TTC16Q8NEE8 873 aa20.73■□□□□ 0.91
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