RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583514.5

LLGL2-221, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-221	ENST00000583514	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	STKLD1	Q8NE28	680 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	MSANTD3	Q96H12	275 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	ACBD6	Q9BR61	282 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	IER2	Q9BTL4	223 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	EPC1	Q9H2F5	836 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	ANO10	Q9NW15	660 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	COL4A2	P08572	1712 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	ANK1	P16157	1881 aa		16.69	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	F11	P03951	625 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CTH	P32929	405 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CXCL12	P48061	93 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	NRL	P54845	237 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	NLRP12	P59046	1061 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	RBP5	P82980	135 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	PLCB2	Q00722	1185 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	MYL7	Q01449	175 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	SATB1	Q01826	763 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	LRRC32	Q14392	662 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	E2F4	Q16254	413 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	STX1A	Q16623	288 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	DDR2	Q16832	855 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	WDR44	Q5JSH3	913 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	OSTM1	Q86WC4	334 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	SIX4	Q9UIU6	781 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	16.68	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CYP2F1	P24903	491 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	HOXD13	P35453	343 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	AVPR1A	P37288	418 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	PON2	Q15165	354 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC142	Q17RM4	750 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	TXNDC8	Q6A555	127 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514		Q6ZS52	159 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	DHX58	Q96C10	678 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	TRIM9	Q9C026	710 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	GKN1	Q9NS71	199 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	INTS13	Q9NVM9	706 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CCL26	Q9Y258	94 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	PTPRJ	Q12913	1337 aa		16.67	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF233	A6NK53	670 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	HCRT	O43612	131 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CSH1	P0DML2	217 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CSH2	P0DML3	217 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	ASIC1	P78348	528 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	MYO1E	Q12965	1108 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	PKMYT1	Q99640	499 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CUEDC2	Q9H467	287 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	ABCB6	Q9NP58	842 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		16.66	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	TNNC2	P02585	160 aa		16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	LHX1	P48742	406 aa		16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	AMPD3	Q01432	767 aa		16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	LPAL2	Q16609	132 aa		16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	MON1A	Q86VX9	555 aa		16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	IQUB	Q8NA54	791 aa		16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	HPDL	Q96IR7	371 aa		16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		16.65	■□□□□ 0.26
LLGL2-221	ENST00000583514	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		16.65	■□□□□ 0.26

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