RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	CYP27A1	Q02318	531 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	PAK1	Q13153	545 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GAREM2	Q75VX8	874 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SMARCD2	Q92925	531 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	PCED1B	Q96HM7	432 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TNIP3	Q96KP6	325 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ASB16	Q96NS5	453 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	KXD1	Q9BQD3	176 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	BDNF	P23560	247 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ASPA	P45381	313 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	RAP1GAP	P47736	663 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GPR15	P49685	360 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	DDR2	Q16832	855 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	POTEH	Q6S545	545 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	FBXL6	Q8N531	539 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GPR152	Q8TDT2	470 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	BCO2	Q9BYV7	579 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SDCBP2	Q9H190	292 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	IL21	Q9HBE4	155 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	WNT16	Q9UBV4	365 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TRIM66	O15016	1216 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	NOL4	O94818	638 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	COL9A1	P20849	921 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GRIK1	P39086	918 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	UNC93A	Q86WB7	457 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	E2F7	Q96AV8	911 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SPATA17	Q96L03	361 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	RAB20	Q9NX57	234 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ATP8B3	O60423	1300 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GNA14	O95837	355 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CFH	P08603	1231 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	FCAR	P24071	287 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ANXA13	P27216	316 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	NLRP12	P59046	1061 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	INCA1	Q0VD86	236 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	WDR44	Q5JSH3	913 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GPR158	Q5T848	1215 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SLC35C1	Q96A29	364 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	MYRFL	Q96LU7	910 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TASP1	Q9H6P5	420 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	18.77	■□□□□ 0.6	5e-9	■■■■■ 167.7
ATG13-223	ENST00000577256	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	F11	P03951	625 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	NDST1	P52848	882 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	STX17	P56962	302 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	GPC5	P78333	572 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	PFKP	Q01813	784 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	CBWD6	Q4V339	395 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		18.76	■□□□□ 0.59

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