RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 TWF1Q12792 350 aa35.24■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RIPOR3Q96MK2 946 aa35.24■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 LPIN3Q9BQK8 851 aa35.24■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOVL4Q9GZR5 314 aa35.24■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-209ENST00000574205 UNC80Q8N2C7 3258 aa35.23■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL16O15467 120 aa35.23■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 FEZF2Q8TBJ5 459 aa35.23■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 KREMEN1Q96MU8 473 aa35.23■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-209ENST00000574205 APBA1Q02410 837 aa35.22■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP35.22■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C12orf29Q8N999 325 aa35.21■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FILIP1LQ4L180 1135 aa35.2■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa35.2■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM49BQ9NUQ9 324 aa35.19■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP72Q9P209 647 aa35.19■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP8B3O60423 1300 aa35.19■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 DOCK6Q96HP0 2047 aa35.19■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC2A14Q8TDB8 520 aa35.17■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SIK3Q9Y2K2 1263 aa35.17■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP44Q17R89 818 aa35.16■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SCN4BQ8IWT1 228 aa35.16■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMG2Q969U7 264 aa35.16■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-209ENST00000574205 UCHL3P15374 230 aa35.15■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF214Q8ND24 703 aa35.15■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP295NLQ96MC4 621 aa35.15■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa35.15■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1257Q9ULG3 409 aa35.15■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYH10P35580 1976 aa35.15■■■■□ 3.22
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