RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	PRRT4	C9JH25	899 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227		H7C1Q1	480 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MOSPD3	O75425	235 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	DNAJB5	O75953	348 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	IL33	O95760	270 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	AHSG	P02765	367 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	NPS	P0C0P6	89 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	LRPAP1	P30533	357 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP2C18	P33260	490 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF134	P52741	427 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	E2F2	Q14209	437 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PCID2	Q5JVF3	399 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TREML2	Q5T2D2	321 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MAVS	Q7Z434	540 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MVB12A	Q96EY5	273 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	GLOD4	Q9HC38	313 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TISP43	B9A030	160 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227		H3BUI4	141 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ADAMTS3	O15072	1205 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	DCLK1	O15075	740 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	BMP15	O95972	392 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PRKCB	P05771	671 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PDHA1	P08559	390 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	LIPA	P38571	399 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PDE1A	P54750	535 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	WNT3	P56703	355 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SOX8	P57073	446 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ANAPC15	P60006	121 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PLS1	Q14651	629 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC157	Q569K6	752 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC35A4	Q96G79	324 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ASB2	Q96Q27	587 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MAP3K14	Q99558	947 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	GABRQ	Q9UN88	632 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MED16	Q9Y2X0	877 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ERC2	O15083	957 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TP73	O15350	636 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNAB3	O43448	404 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	UNC5C	O95185	931 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	GRP	P07492	148 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNJ5	P48544	419 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PDE6C	P51160	858 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CLCN2	P51788	898 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TPTE	P56180	551 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	EVA1C	P58658	441 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	LILRA4	P59901	499 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	LAMB3	Q13751	1172 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227		Q6ZWC4	215 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	GALNT16	Q8N428	558 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91

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