RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SNX25	Q9H3E2	840 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SHISA7	A6NL88	538 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SOBP	A7XYQ1	873 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ARNTL	O00327	626 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TACC1	O75410	805 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CCNE1	P24864	410 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	AVPR1A	P37288	418 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GRIK1	P39086	918 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGEA11	P43364	429 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CASP4	P49662	377 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MYL6	P60660	151 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TNNC1	P63316	161 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP27A1	Q02318	531 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FZD5	Q13467	585 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	BIRC3	Q13489	604 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MYRFL	Q96LU7	910 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SCN1A	P35498	2009 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NCAN	O14594	1321 aa		10.05	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR23A	A6NEV1	266 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NOL4	O94818	638 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	RHOBTB3	O94955	611 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF202	O95125	648 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NR3C1	P04150	777 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR29	P0C7W0	189 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	BDNF	P23560	247 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CLDN10	P78369	228 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	DPYD	Q12882	1025 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC142	Q17RM4	750 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP135	Q66GS9	1140 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TXNDC8	Q6A555	127 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	VSTM1	Q6UX27	236 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MON1A	Q86VX9	555 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	STKLD1	Q8NE28	680 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TTC8	Q8TAM2	541 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MYLPF	Q96A32	169 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MSANTD3	Q96H12	275 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA17	Q96L03	361 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GKN1	Q9NS71	199 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TDP1	Q9NUW8	608 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ANK1	P16157	1881 aa		10.04	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MXQ7	604 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	IKBKB	O14920	756 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CLSTN1	O94985	981 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PRAMEF12	O95522	483 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ANXA13	P27216	316 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	DLG4	P78352	724 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NUCB2	P80303	420 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NCOA4	Q13772	614 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNB1	Q14721	858 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8

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