RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 MOSPD3O75425 235 aa23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CEBPBP17676 345 aa23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 NDST1P52848 882 aa23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 INCA1Q0VD86 236 aa23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 POTEHQ6S545 545 aa23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 VSTM1Q6UX27 236 aa23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 TNIP3Q96KP6 325 aa23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23.06■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 MYO10Q9HD67 2058 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 ANHXE9PGG2 379 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 P4HA2O15460 535 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 BDNFP23560 247 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 KCNH2Q12809 1159 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 TATDN2Q93075 761 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 MCRS1Q96EZ8 462 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 GDE1Q9NZC3 331 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 GJA1P17302 382 aa23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 ZXDAP98168 799 aa23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 ACOT1Q86TX2 421 aa23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 SHKBP1Q8TBC3 707 aa23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 EDAQ92838 391 aa23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 NXPE3Q969Y0 559 aa23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.04■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CILPO75339 1184 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 FGF19O95750 216 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CD58P19256 250 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 ORC1Q13415 861 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 HTR4Q13639 388 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 TAF12Q16514 161 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 GAREM2Q75VX8 874 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 WHAMMQ8TF30 809 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 TWNKQ96RR1 684 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 IL21Q9HBE4 155 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.03■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 A0A1W2PRU2 124 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 NOL4O94818 638 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CSH1P0DML2 217 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CSH2P0DML3 217 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 GABRR2P28476 465 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 GRIK1P39086 918 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CETN1Q12798 172 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 TDGQ13569 410 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 MTMR3Q13615 1198 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 TEAD2Q15562 447 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 PARM1Q6UWI2 310 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 TTC39CQ8N584 583 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 STKLD1Q8NE28 680 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 SPATA17Q96L03 361 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 THAP9Q9H5L6 903 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CISHQ9NSE2 258 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 TRIOO75962 3097 aa23.02■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 CLDN5O00501 218 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 LRMPQ12912 555 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 MTSS1LQ765P7 747 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 LMO3Q8TAP4 145 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 FGF14Q92915 247 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 C8orf48Q96LL4 319 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 ZSWIM3Q96MP5 696 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 ARID3AQ99856 593 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 GPR88Q9GZN0 384 aa23.01■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 PTPRDP23468 1912 aa23■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 TRIM66O15016 1216 aa23■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 CDC25CP30307 473 aa23■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 CACNA2D1P54289 1103 aa23■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 CUL2Q13617 745 aa23■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 FAM35AQ86V20 835 aa23■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 UBALD2Q8IYN6 164 aa23■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 FUKQ8N0W3 1084 aa23■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 C12orf29Q8N999 325 aa23■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NME3-210ENST00000567271 MYRFLQ96LU7 910 aa23■■□□□ 1.27
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