RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843		H7C1Q1	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FGB	P02675	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FES	P07332	822 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PDE1A	P54750	535 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	DSC2	Q02487	901 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	USP37	Q86T82	979 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	RGS19	P49795	217 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	USP1	O94782	785 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	GNAI2	P04899	355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	IL1R2	P27930	398 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	GLG1	Q92896	1179 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	MARK4	Q96L34	752 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SCP2	P22307	547 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	TPTE	P56180	551 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843		Q6ZWC4	215 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FCHO1	O14526	889 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	ADAM10	O14672	748 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	DCLK1	O15075	740 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	EXOC3	O60645	756 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	TJP3	O95049	919 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PDE8B	O95263	885 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	LOXL3	P58215	753 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	GPSM2	P81274	684 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	POLH	Q9Y253	713 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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