RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557500.2

TVP23BP1-201, Transcript of TVP23B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TVP23BP1, Length 617 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BP1-201ENST00000557500 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 SMPD4Q9NXE4 827 aa4.56□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.56□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.56□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 CDH9Q9ULB4 789 aa4.56□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 MAFFQ9ULX9 164 aa4.56□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ASB3Q9Y575 518 aa4.56□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 REV3LO60673 3130 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 FAM170AA1A519 330 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 F8VP50 259 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 GPR37L1O60883 481 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 C1RP00736 705 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 CYP11A1P05108 521 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 DCNP07585 359 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 TPM2P07951 284 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 FAM200BP0CF97 657 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 CSH1P0DML2 217 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 CSH2P0DML3 217 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 CCDC192P0DO97 292 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 IRF1P10914 325 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 SRFP11831 508 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 KRT5P13647 590 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 CCDC130P13994 396 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ATF6P18850 670 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 WARSP23381 471 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 CCNE1P24864 410 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 HOXA9P31269 272 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 PPP1R2P41236 205 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 CCR2P41597 374 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 MAP3K7CLP57077 242 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 PFKPQ01813 784 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 LRRC63Q05C16 580 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 PPP3CAQ08209 521 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 EHHADHQ08426 723 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 SMARCB1Q12824 385 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 PAK1Q13153 545 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 HTR4Q13639 388 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 KRT39Q6A163 491 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 TXNDC8Q6A555 127 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 SASS6Q6UVJ0 657 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 RTL10Q7L3V2 364 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 TTC30AQ86WT1 665 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ADSSL1Q8N142 457 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 PPM1KQ8N3J5 372 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 C12orf29Q8N999 325 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 SLC2A14Q8TDB8 520 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 TMC2Q8TDI7 906 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 FBXO32Q969P5 355 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 PSMG2Q969U7 264 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 PCED1BQ96HM7 432 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZSWIM3Q96MP5 696 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 TIGD1Q96MW7 591 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 CYP2S1Q96SQ9 504 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 HINFPQ9BQA5 517 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 NT5C1AQ9BXI3 368 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 FOXQ1Q9C009 403 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ELOVL4Q9GZR5 314 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 NIF3L1Q9GZT8 377 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 PDCL3Q9H2J4 239 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 TBC1D17Q9HA65 648 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ARHGEF3Q9NR81 526 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 KRT82Q9NSB4 513 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 GDAP2Q9NXN4 497 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 GDE1Q9NZC3 331 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 EHD2Q9NZN4 543 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 DACH1Q9UI36 760 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 NLRC5Q86WI3 1866 aa4.55□□□□□ -1.68
TVP23BP1-201ENST00000557500 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms