RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 GUCY1A2P33402 732 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NR2C2P49116 596 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NFIAQ12857 509 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 OLFM3Q96PB7 478 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 B3GAT3O94766 335 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CRTAMO95727 393 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 IL1R1P14778 569 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CASP1P29466 404 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GGCXP38435 758 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GALCP54803 685 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM253P0C7T8 217 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RGS7P49802 495 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PHF21AQ96BD5 680 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AGAP3Q96P47 875 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM66O15016 1216 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM16O95361 564 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FAM107AO95990 144 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AMHP03971 560 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PLA2G4AP47712 749 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PPIL2Q13356 520 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRABDQ9H4I3 376 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 A0A087WZ62 844 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CYB561D2O14569 222 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MAP3K13O43283 966 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AP1G2O75843 785 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SKP1P63208 163 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 METTL7BQ6UX53 244 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KSR1Q8IVT5 923 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 M0R3G1 203 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 VWA5AO00534 786 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SERPIND1P05546 499 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GYS1P13807 737 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 STX3Q13277 289 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ADCK2Q7Z695 626 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GPC2Q8N158 579 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 A0A087WWV3 80 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CNGA3Q16281 694 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 C4orf19Q8IY42 314 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TASP1Q9H6P5 420 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SLIT3O75094 1523 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEB16A2A368 324 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HEATR9A2RTY3 570 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.65□□□□□ -1.34
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