RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 NFYCQ13952 458 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CARTPTQ16568 116 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 GSTA3Q16772 222 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 RNF139Q8WU17 664 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 RAD54LQ92698 747 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 MAGEA2P43356 314 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CCT8P50990 548 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 AP1S2P56377 157 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 RHAGQ02094 409 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 ALCAMQ13740 583 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 DGCR6Q14129 220 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 ACCSLQ4AC99 568 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SGF29Q96ES7 293 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.95□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 BNIP3LO60238 219 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 MTM1Q13496 603 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SMU1Q2TAY7 513 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC115Q96NT0 180 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SEPHS2Q99611 448 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 GIN1Q9NXP7 522 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 COMMD9Q9P000 198 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 A0A0G2JPF8 293 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 HS6ST1O60243 411 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 MAPK6Q16659 721 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 FAR1Q8WVX9 515 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 WRNIP1Q96S55 665 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 TRIM54Q9BYV2 358 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 ATP8B3O60423 1300 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CLRN2A0PK11 232 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 PLOD3O60568 738 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SLC26A3P40879 764 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 BTN3A2P78410 334 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CDC73Q6P1J9 531 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 COMMD8Q9NX08 183 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CD274Q9NZQ7 290 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF682O95780 498 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC166P0CW27 439 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 MLNP12872 115 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CYP51A1Q16850 503 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SYTL3Q4VX76 610 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 PID1Q7Z2X4 250 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 EID3Q8N140 333 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 PTPRN2Q92932 1015 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 BHMTQ93088 406 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 EHD4Q9H223 541 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 H7C0S8 307 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 MATN2O00339 956 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 TTKP33981 857 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 KCNJ1P48048 391 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 VAMP7P51809 220 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 COPZ1P61923 177 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 UBE2SQ16763 222 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 OR8H3Q8N146 312 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 KYQ8NBH2 561 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-216ENST00000545170 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms